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J-GLOBAL ID：201902257494548439   整理番号：19A2039829

ベトナム,2016で検出されたDS-1様主鎖遺伝子を持つネコ様G3P[8]再集合体ロタウイルスA株の全ゲノム特性化【JST・京大機械翻訳】

Whole genome characterization of feline-like G3P[8] reassortant rotavirus A strains bearing the DS-1-like backbone genes detected in Vietnam, 2016

著者 (11件)： Hoa-Tran Thi Nguyen (Department of Virology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Nakagomi Toyoko (Department of Hygiene and Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Vu Hung Manh (Department of Virology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Kataoka Chikako (Research Center for Zoonosis Control, Hokkaido University, Sapporo, Japan) ,  Nguyen Trang Thi Thu (Department of Virology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Dao Anh Thi Hai (Department of Virology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Nguyen Anh The (Department of Virology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Takemura Taichiro (Vietnam Research Station, National Institute of Hygiene and Epideimmiology-Nagasaki University, Hanoi, Viet Nam) ,  Hasebe Futoshi (Vietnam Research Station, Center for Infectious Disease Research in Asia and Africa, Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Dang Anh Duc (Department of Bacteriology, National Institute of Hygiene and Epidemiology, Hanoi, Viet Nam) ,  Nakagomi Osamu (Department of Hygiene and Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 73  ページ： 1-6  発行年： 2019年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ベトナムにおけるロタウイルス胃腸炎サーベイランスを実施しながら,同一の短いRNA電気泳動型を有する2つのG3P[8]ロタウイルスA標本を検出した。それらはRVA/Human-wt/VNM/0232/2016/G3P[8]とRVA/Human-wt/VNM/0248/2016/G3P[8]であり,それぞれ9歳と23か月の男児から回復した。患者は2016年3月に1週間以内に下痢を発症したが,ベトナム北部においては>100km離れていた。2つのG3P[8]ロタウイルスA株の全ゲノム配列決定は,それらのゲノムRNA配列が11のゲノムセグメントを横切って同一であることを明らかにし,それらが単一クローンから由来することを示唆した。骨格遺伝子配置はI2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2であった。バックボーン遺伝子とVP4遺伝子は,実質的に同一のヌクレオチド配列を持ち,RVA/Huan-wt/VNM/1149/2014/G8P[8]の対応する遺伝子に対して99.2から100%の範囲の同一性を持っていた。ベトナムにおける最近出現しているボビン様G8P[8]再集合株のプロトタイプ。一方,VP7遺伝子はRVA/Human-wt/CHN/E2451/2011/G3P[9]のそれと98.8%同一であり,それらはRVA/Cat-tc/JPN/FRV-1/1986/G3P[9]によって表された系統において一緒にクラスタ化された。観察により,DS-1様骨格遺伝子を有するウシ様G8P[8]株の1つは,G3 VP7遺伝子を獲得するために局所的に循環するFRV-1様株で再分類され,これらの非記述のネコ様G3P[8]再集合株として出現すると仮定した。DS-1様骨格遺伝子を有するネコ様G3P[8]株の同定は,出現株で生じる進化的変化と共循環株との相互作用をモニターし,記述し,理解するための全ゲノム配列決定アプローチの強度と必要性を示す。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クローン ,  ヌクレオチド配列 ,  電気泳動 ,  *遺伝子 ,  *ゲノム ,  クラスタ化 ,  ヒト ,  *キャラクタリゼーション ,  サーベイランス ,  プロトタイプ ,  *ロタウイルス ,  *ベトナム社会主義共和国 ,  RNA【核酸】 ,  相互作用
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Rotavirus感染症 ,  再構成ウイルス ,  ネコ様のg3 ,  ベトナム ,  胃腸炎

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (10件)： ベトナム ,  DS-1 ,  主鎖 ,  遺伝子 ,  ネコ ,  集合体 ,  ロタウイルス ,  株 ,  ゲノム ,  特性化