文献

J-GLOBAL ID：201902259194643491   整理番号：19A1651514

肉牛における飼料効率の重要な調節因子としてのNR2F6およびTGFB1を明らかにするシステム生物学【JST・京大機械翻訳】

Systems Biology Reveals NR2F6 and TGFB1 as Key Regulators of Feed Efficiency in Beef Cattle

著者 (7件)： Alexandre Pamela A. (Department of Veterinary Medicine, College of Animal Sciences and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Brazil) ,  Alexandre Pamela A. (Agriculture and Food, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Brisbane, QLD, Australia) ,  Naval-Sanchez Marina (Agriculture and Food, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Brisbane, QLD, Australia) ,  Porto-Neto Laercio R. (Agriculture and Food, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Brisbane, QLD, Australia) ,  Ferraz Jose Bento S. (Department of Veterinary Medicine, College of Animal Sciences and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Brazil) ,  Reverter Antonio (Agriculture and Food, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Brisbane, QLD, Australia) ,  Fukumasu Heidge (Department of Veterinary Medicine, College of Animal Sciences and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Brazil)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 230  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： システム生物学アプローチは,複雑な表現型に関連する組織特異的摂動と調節遺伝子を発見する戦略として用いられている。著者らは,経済的および環境的に重要な特性である肉牛における飼料効率(FE)を研究するためにこのアプローチを適用した。高いおよび低いFEのために選択された,18の若い雄牛の5つの組織(副腎,視床下部,肝臓,骨格筋および下垂体)のポリA選択RNAを配列決定した(Illina HiSeq2500,100bp,pared-end)。すべての組織を考慮した17354の発現遺伝子から,1,335は5つの選択カテゴリー(異なる発現,FEに関連したSNP,組織特異的,血漿中に分泌され,重要な調節因子)により優先され,ネットワーク構築に使用された。NR2F6およびTGFB1は,それぞれ,肝臓炎症反応および筋肉組織発生の重要な調節因子としてモチーフ発見により同定され,検証され,2つの生物学的過程がFEと関連することが示された。さらに,代謝と性成熟のホルモン制御に関連するFEの潜在的バイオマーカーを示した。ロバストな方法論と検証戦略を用いることにより,Bos indicusにおけるFEに関連する主要な生物学的過程を確認し,優れた動物の調節因子またはバイオマーカーとして候補遺伝子を示した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  ロバスト性 ,  バイオマーカー ,  ポリAMP ,  *肉牛 ,  *飼料効率 ,  骨格筋 ,  血漿 ,  遺伝子 ,  副腎 ,  RNA【核酸】 ,  表現型
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  コブウシ ,  *調節因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 飼料効率 ,  残留飼料摂取量 ,  Nellore(Zebu) ,  Bos indicus ,  炎症 ,  筋肉の発達 ,  モチーフ発見 ,  調節遺伝子ネットワーク

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (100件)：

• Aerts S., Quan X. J., Claeys A., Sanchez M. N., Tate P., Yan J., et al (2010). Robust target gene discovery through transcriptome perturbations and genome-wide enhancer predictions in drosophila uncovers a regulatory basis for sensory specification. PLoS Biol. 8:e1000435. doi: 10.1371/journal.pbio.1000435.g001
• Alexandre P. A., Kogelman L. J. A., Santana M. H. A., Passarelli D., Pulz L. H., Fantinato-Neto P., et al (2015). Liver transcriptomic networks reveal main biological processes associated with feed efficiency in beef cattle. BMC Genomics 16:1073. doi: 10.1186/s12864-015-2292-8
• Anders S., Pyl P. T., Huber W. (2014). HTSeq - A Python framework to work with high-throughput sequencing data. Bioinformatics 31 166-169. doi: 10.1093/bioinformatics/btu638
• Archer J. A., Arthur P. F., Herd R. M., Parnell P. F., Pitchford W. S. (1997). Optimum postweaning test for measurement of growth rate, feed intake, and feed efficiency in British breed cattle. J. Anim. Sci. 75 2024-2032. doi: 10.2527/1997.7582024x
• Archer J. A., Richardson E. C., Herd R. M., Arthur P. F. (1999). Potential for selection to improve efficiency of feed use in beef cattle: a review. Aust. J. Agric. Res. 50 147-161. doi: 10.1071/A98075

タイトルに関連する用語 (4件)： 肉牛 ,  飼料効率 ,  調節因子 ,  システム生物学