文献

J-GLOBAL ID：201902259560044668   整理番号：19A2290605

Fusarium oxysporum f.sp.cubenseのfub遺伝子における遺伝的多様性は水平遺伝子導入を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity in FUB Genes of Fusarium oxysporum f. sp. cubense Suggests Horizontal Gene Transfer

著者 (8件)： Liu Siwen (1College of Horticulture, Shenyang Agricultural University, Shenyang, China) ,  Wu Bo (2Key Laboratory of South Subtropical Fruit Biology and Genetic Resource Utilization, Ministry of Agriculture, Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research of Guangdong Province, Institution of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, Ch...) ,  Lv Shuxia (3College of Bioscience and Biotechnology, Shenyang Agricultural University, Shenyang, China) ,  Shen Zongzhuan (4Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization, Key Laboratory of Plant Nutrition and Fertilization in Low-Middle Reaches of the Yangtze River, Ministry of Agriculture, College of Resources and Environmental Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Li Rong (4Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization, Key Laboratory of Plant Nutrition and Fertilization in Low-Middle Reaches of the Yangtze River, Ministry of Agriculture, College of Resources and Environmental Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Yi Ganjun (2Key Laboratory of South Subtropical Fruit Biology and Genetic Resource Utilization, Ministry of Agriculture, Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research of Guangdong Province, Institution of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, Ch...) ,  Li Chunyu (2Key Laboratory of South Subtropical Fruit Biology and Genetic Resource Utilization, Ministry of Agriculture, Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research of Guangdong Province, Institution of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, Ch...) ,  Guo Xiuwu (1College of Horticulture, Shenyang Agricultural University, Shenyang, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 10  ページ： 1069  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フザリン酸(FA)は,多くのFusarium種の重要な二次代謝産物であり,Fusarium oxysporum f. sp. cubense(Foc)によるバナナで引き起こされる萎凋病症状に関与している。12のFoc FA生合成遺伝子(FUB)の進化特性を調査するために,12のFUB遺伝子のコード配列と3つのハウスキーピング遺伝子,EF-1α/RPB1/RPB2(翻訳伸長因子-1α/RNAポリメラーゼIIサブユニットII)を遺伝的多様性分析,系統発生分析,組換え検出,および選択的圧力分析にかけた。選択的圧力分析の結果は,15の遺伝子が主に負の選択を受けたことを示した。しかし,選択的圧力差によって簡単に説明できない有意に高い数のサイレント突然変異が,3つのハウスキーピング遺伝子におけるよりもFocにおける12のFUB遺伝子において観察された。系統発生と組換え検出分析は,有意により多くの水平遺伝子移動(HGT)イベント(正規化)が,3つのハウスキーピング遺伝子よりFUB遺伝子において発生したことを示した。加えて,これらのイベントの多くは,アウトグループ分離株を含み,FocにおけるFUB遺伝子の遺伝的多様性を有意に増加させた。系統発生分析により,Focに対して提案された多系統発生は更なる議論を必要とし,非バナナ植物に病原性のいくつかのF.oxysporum(Fo)分離株の共通祖先は短期間にわたって分岐することを示唆した。最後に,著者らの結果は,FoにおけるFUB遺伝子がHGTから利益を得て,主に負の選択を受けているにもかかわらず,異なる宿主植物と環境に応答するために比較的高い遺伝的多様性を獲得することを示唆する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  二次代謝産物 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  *Fusarium oxysporum ,  サブユニット ,  正規化 ,  系統発生 ,  バナナ ,  病原性 ,  突然変異 ,  *Fusarium ,  カルボン酸 ,  窒素複素環化合物
準シソーラス用語： 分離株 ,  系統解析 ,  ペプチド鎖延長因子1 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Panama病 ,  Fusarium oxysporum f.sp.cubense ,  フザリン酸 ,  水平遺伝子導入 ,  系統発生

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： フザリン酸

引用文献 (49件)：

• Bohni N., Hofstetter V., Gindro K., Buyck B., Schumpp O., Bertrand S., et al. (2016). Production of fusaric acid by Fusarium spp. in pure culture and in solid medium co-cultures. Molecules 21, 370. doi: doi: 10.3390/molecules21030370
• Boni M. F., Posada D., Feldman M. W. (2007). An exact nonparametric method for inferring mosaic structure in sequence triplets. Genetics 176, 1035-1047. doi: doi: 10.1534/genetics.106.068874
• Brown D. W., Butchko R. A. E., Busman M., Proctor R. H. (2012). Identification of gene clusters associated with fusaric acid, fusarin, and perithecial pigment production in Fusarium verticillioides. Fungal Genet. Biol. 49, 521-532. doi: doi: 10.1016/j.fgb.2012.05.010
• Brown D. W., Lee S.-H., Kim L.-H., Ryu J.-G., Lee S., Seo Y., et al. (2015). Identification of a 12-gene fusaric acid biosynthetic gene cluster in Fusarium species through comparative and functional genomics. Mol. Plant Microbe Interact. 28, 319-332. doi: doi: 10.1094/MPMI-09-14-0264-R
• Chen N. W. G., Serres-Giardi L., Ruh M., Briand M., Bonneau S., Darrasse A., et al. (2018). Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. BMC Genomics 19, 606. doi: doi: 10.1186/s12864-018-4975-4

タイトルに関連する用語 (4件)： Fusarium ,  遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  水平遺伝子導入