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J-GLOBAL ID：201902259860518794   整理番号：19A2654612

ヒト心房老化と関連したmiRNAおよびmRNA発現プロファイルの統合分析【JST・京大機械翻訳】

Integrative Analysis of miRNA and mRNA Expression Profiles Associated With Human Atrial Aging

著者 (13件)： Yao Yan (Department of Cardiology, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Jiang Chenxi (Department of Cardiology, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Wang Fan (Center for Cardiovascular Genetics, Department of Molecular Cardiology, Lerner Research Institute, Cleveland Clinic, Case Western Reserve University, Cleveland, OH, United States) ,  Yan Han (Department of Human Population Genetics and Beijing Key Laboratory of Cardiometabolic Molecular Medicine, Institute of Molecular Medicine, Peking University, Beijing, China) ,  Long Deyong (Department of Cardiology, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Zhao Jinghua (Department of Cardiology, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Wang Jiangang (Department of Cardiac Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Zhang Chunxiao (Department of Cardiac Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Li Yang (Department of Human Population Genetics and Beijing Key Laboratory of Cardiometabolic Molecular Medicine, Institute of Molecular Medicine, Peking University, Beijing, China) ,  Tian Xiaoli (Department of Human Population Genetics and Beijing Key Laboratory of Cardiometabolic Molecular Medicine, Institute of Molecular Medicine, Peking University, Beijing, China) ,  Wang Qing K. (Center for Cardiovascular Genetics, Department of Molecular Cardiology, Lerner Research Institute, Cleveland Clinic, Case Western Reserve University, Cleveland, OH, United States) ,  Wu Gang (Department of Cardiology, Renmin Hospital of Wuhan University, Wuhan, China) ,  Zhang Zhihui (Department of Cardiology, The Third Xiangya Hospital of Central South University, Changsha, China)
資料名： Frontiers in Physiology (Web)  (Frontiers in Physiology (Web))
巻： 10  ページ： 1226  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7093A  ISSN： 1664-042X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:限られた知見は,加齢したヒト心房におけるmiRNAおよびmRNA発現プロファイルを系統的に検討するために報告されている。本研究では,ヒト心房老化(AA)に対するmiRNA,遺伝子およびmiRNA-mRNA相互作用ネットワークを同定することを目的とした。【方法】大動脈弁置換を受けた12人の患者からの右心房付属器をmiRNA-seqとRNA-seqにかけた。すべての患者は洞調律(SR)で,4つの群に年齢によって層別化された。示差発現分析を行い,ヒトAAのmiRNAと遺伝子を同定した。ヒトAAに対するmiRNA-mRNA相互作用をピアソン相関分析とmiRNA標的予測プログラムにより同定した。【結果】7つのmiRNA(4つのアップレギュレーションと3つのダウンレギュレーション)と42の遺伝子(23のアップレギュレーションと19のダウンレギュレーション)は,より古いサンプルとより若いサンプルの間のヒトの右心房組織で差別的に発現した。生物情報学的分析により,AAに関する114対の推定miRNA-mRNA相互作用と4つのタイプの相関を同定した。経路濃縮分析は40以上の有意な経路を同定し,上部3経路は,癌における律動的過程(P=7.5×10~5,Q=0.034),老化と自食作用(P=9.0×10~5,Q=0.034),およびサイトカイン生合成過程の陽性調節(P=1.1×10~4,Q=0.034)を含んだ。結論:著者らの研究は,AAに対する新規miRNA-mRNA相互作用ネットワークとシグナル伝達経路を明らかにし,ヒトAAの発生への新しい洞察を提供する。ヒトAAまたはAA関連心血管疾患におけるこれらmiRNA-mRNA相互作用の潜在的意義を検討するために,将来の研究が必要である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アップレギュレーション ,  *心房 ,  ネットワーク ,  *老化 ,  *ヒト ,  オートファジー ,  ダウンレギュレーション ,  相互作用 ,  遺伝子 ,  *mRNA
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  RNA-seq ,  右心房 ,  *mRNA発現 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 心房老化 ,  miRNA ,  mRNA ,  相互作用 ,  シグナル伝達経路

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (56件)：

• Anders S., Pyl P. T., Huber W. (2015). HTSeq-a Python framework to work with high-throughput sequencing data. Bioinformatics 31 166-169. doi: 10.1093/bioinformatics/btu638
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• Bartsch R. P., Liu K. K., Bashan A., Ivanov P. C. (2015). Network physiology: how organ systems dynamically interact. PLoS One 10:e0142143. doi: 10.1371/journal.pone.0142143
• Bashan A., Bartsch R. P., Kantelhardt J. W., Havlin S., Ivanov P. C. (2012). Network physiology reveals relations between network topology and physiologic function. Nat. Commun. 3:702. doi: 10.1038/ncomms1705
• Betel D., Koppal A., Agius P., Sander C., Leslie C. (2010). Comprehensive modeling of microRNA targets predicts functional non-conserved and non-canonical sites. Genome Biol. 11:R90. doi: 10.1186/gb-2010-11-8-r90

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒト ,  心房 ,  老化 ,  miRNA ,  mRNA発現 ,  プロファイル ,  統合 ,  分析