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J-GLOBAL ID：201902259896721498   整理番号：19A0462737

Thermus thermophilus由来のペプチジル-tRNAヒドロラーゼの高分解能結晶構造【JST・京大機械翻訳】

High-resolution crystal structure of peptidyl-tRNA hydrolase from Thermus thermophilus

著者 (7件)： Matsumoto Ami (Faculty of Science, Department of Biology, Niigata University, Niigata, Japan) ,  Uehara Yuji (Faculty of Science, Department of Biology, Niigata University, Niigata, Japan) ,  Shimizu Yoshihiro (Department of Medical Genome Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Chiba, Japan) ,  Shimizu Yoshihiro (Laboratory for Cell-Free Protein Synthesis, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, Osaka, Japan) ,  Ueda Takuya (Department of Medical Genome Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Chiba, Japan) ,  Uchiumi Toshio (Faculty of Science, Department of Biology, Niigata University, Niigata, Japan) ,  Ito Kosuke (Faculty of Science, Department of Biology, Niigata University, Niigata, Japan)
資料名： Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics  (Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics)
巻： 87  号： 3  ページ： 226-235  発行年： 2019年 
JST資料番号： T0761A  ISSN： 0887-3585  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペプチジルtRNAヒドロラーゼ(Pth)はペプチドとの間のエステル結合を切断し,蛋白質合成のさらなるラウンドのためにtRNAをリサイクルするために,欠陥のある翻訳の産物であるペプチジルtRNA分子のtRNAを切断する。PTHは自然界で普遍的であり,その活性は細菌の生存性に必須である。ここでは,1.00Å解像度でThermus thermophilus(TtPth)からPthの結晶構造を決定した。これは好熱性細菌からのPthの最初の構造であり,今までに報告された最高の分解能Pth構造である。この原子分解能データは,すべての原子に対する異方性変位パラメータの計算を可能にし,基板認識に対する重要な領域のゆらぎの方向性を明らかにした。TtPthと中温性細菌PTHsの間の比較は,それらの構造が全体的に類似していることを明らかにした。しかし,N-およびC-末端,ループ-ヘリックスα4およびヘリックスα6領域の構造は異なっていた。加えて,TtPthの鎖β4領域に対するヘリックスα1は中温性細菌PTHsのそれらとは著しく異なっている。なぜなら,この領域は中温性細菌PTHsのそれらより短い9または10アミノ酸残基であるからである。この短縮はTtPthの熱安定性に寄与すると思われる。TtPthの熱安定性の決定因子をさらに理解するために,TtPthの種々の構造因子を中温性細菌PTHsのそれらと比較した。データは,接近可能な表面積と熱不安定アミノ酸残基の減少,およびイオン対,水素結合,およびプロリン残基の増加が,TtPthの熱安定性に協調的に寄与することを示唆する。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *Thermus thermophilus ,  熱安定性 ,  *tRNA ,  *細菌 ,  タンパク質合成 ,  *結晶構造 ,  ペプチド ,  水素結合 ,  中温 ,  *ヒドロラーゼ ,  異方性 ,  ゆらぎ ,  アミノ酸残基 ,  ペプチジルtRNA ,  *サーマス属 ,  *微生物
準シソーラス用語： *Thermus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 原子分解能 ,  動力学 ,  ペプチジル-tRNAヒドロラーゼ ,  耐熱性 ,  翻訳 ,  X線結晶学

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： Thermus ,  tRNA ,  ヒドロラーゼ ,  高分解能 ,  結晶構造