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J-GLOBAL ID：201902261338612014   整理番号：19A0329939

サブヌクレオソームゲノム構造は異なるヌクレオソーム折畳みモチーフを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Sub-nucleosomal Genome Structure Reveals Distinct Nucleosome Folding Motifs

著者 (7件)： Ohno Masae (Laboratory for Cell Systems Control, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, Japan) ,  Ando Tadashi (Laboratory for Biomolecular Function Simulation, Quantitative Biology Center, RIKEN, 6-7-1 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe, Hyogo 650-0047, Japan) ,  Priest David G. (Laboratory for Cell Systems Control, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, Japan) ,  Kumar Vipin (Laboratory for Cell Systems Control, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, Japan) ,  Yoshida Yamato (Laboratory for Cell Systems Control, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, Japan) ,  Taniguchi Yuichi (Laboratory for Cell Systems Control, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565-0874, Japan) ,  Taniguchi Yuichi (PRESTO, Japan Science and Technology Agency, 4-1-8 Honcho, Kawaguchi, Saitama, 332-0012, Japan)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 176  号： 3  ページ： 520-534.e25  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムワイドな階層的クロマチン構造を支配する全体的および局所的規則を解明することは,重要な課題のままである。現在のハイスループット染色体立体配座捕獲(Hi-C)技術は,トポロジー的に関連するドメインやループのような大規模なクロマチン構造モチーフを同定している。しかし,最小またはヌクレオソームスケールでの構造規則はほとんど理解されていない。ここでは,ヌクレオソームの3D空間分布とクロマチンにおけるそれらの全ゲノム配向を明らかにするために,シミュレーションアニーリング-分子動力学(SA-MD)シミュレーションとヌクレオソーム分解Hi-C技術を結合した。Hi-COと呼ばれる著者らの方法は,酵母ゲノムを横切る異なるヌクレオソーム折畳みモチーフを明らかにした。著者らの結果は,ヌクレオソーム折畳みにおける2つのタイプの基本的二次構造モチーフを明らかにした:蛋白質折畳みにおけるαヘリックス及びβシートモチーフに類似したα-四面体及びβ-rhomバス。突然変異体と細胞周期同期細胞を用いて,個々の遺伝子座における特異的ヌクレオソーム位置決めと後成的特徴に結合した配向を持つモチーフをさらに明らかにした。真核生物クロマチンにおける分子レベル構造-機能関係を明らかにすることにより,著者らの知見はヌクレオソーム折畳みの組織的原理を確立する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *折畳み ,  位相幾何学 ,  細胞周期 ,  酵母 ,  *ゲノム ,  シミュレーション ,  *ヌクレオソーム ,  立体配座 ,  位置決め ,  真核生物 ,  分子動力学 ,  β構造
準シソーラス用語： αヘリックス ,  ドメイン構造 ,  ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： ヌクレオソーム ,  折畳み ,  モチーフ