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J-GLOBAL ID：201902263220747359   整理番号：19A0494732

微細マッピングとトランスクリプトーム解析はキャベツ(Brassica oleracea)における雑種致死性に関連する候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Fine Mapping and Transcriptome Analysis Reveal Candidate Genes Associated with Hybrid Lethality in Cabbage (Brassica Oleracea)

著者 (13件)： Xiao Zhiliang (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Hu Yang (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Zhang Xiaoli (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Xue Yuqian (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Fang Zhiyuan (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Yang Limei (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Zhang Yangyong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Liu Yumei (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Li Zhansheng (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Liu Xing (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Liu Zezhou (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Lv Honghao (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Zhuang Mu (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, No. 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 6  ページ： 147  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 雑種致死性は種進化に重要な有害表現型である。キャベツ(Brassica oleracea)の雑種致死性を以前に報告し,関連遺伝子の予備マッピングを行った。本研究において,ハイブリッド致死遺伝子の微細マッピングにより,BoHL1はBoHLTO124とBoHLTO130の間の染色体C1に位置し,101kbの間隔を有することを明らかにした。BoHL2は,70kbのマーカー間隔で,C4上の挿入欠失(InDels)マーカーHL234とHL235の間にあることを確認した。BoHL1およびBoHL2の2つの間隔内で,それぞれ28および9つの注釈遺伝子を見出した。著者らはまた,キャベツにおけるハイブリッド致死性を分析するためにRNA-Seqを適用した。BoHL1の領域において,7つの差別的に発現した遺伝子(DEG)と5つの耐性(R)関連遺伝子(共通の2つ,すなわち,Bo1g153320とBo1g153380)が見出された。一方,BoHL2の領域では,2つのDEGと4つのR関連遺伝子(2つは一般的,すなわち,Bo4g173780とBo4g173810)が見られた。R遺伝子が他の植物における雑種致死性にしばしば関与する研究と共に,これらの興味深いR-DEGは雑種致死性に関連する良好な候補である可能性がある。また,結果を確認するために,SNP/InDel分析と定量的リアルタイムPCRを用いた。本研究はキャベツにおける雑種致死のメカニズムに関する新しい洞察を提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  染色体 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  表現型 ,  致死遺伝子 ,  *キャベツ
準シソーラス用語： 定量的リアルタイムPCR法 ,  R遺伝子 ,  *致死性 ,  *候補遺伝子 ,  *雑種致死 ,  トランスクリプトーム解析 ,  *微細マッピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： キャベツ ,  ハイブリッド致死性 ,  微細マッピング ,  トランスクリプトーム解析

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  稲作  (FC03020C)

引用文献 (54件)：

• Orr, H.A.; Presgraves, D.C. Speciation by postzygotic isolation: Forces, genes and molecules. Bioessays 2000, 22, 1085-1094.
• Bomblies, K.; Weigel, D. Hybrid necrosis: Autoimmunity as a potential gene-flow barrier in plant species. Nat. Rev. Genet. 2007, 8, 382-393.
• Wiebe, G.A. Complementary factors in barley giving a lethal progeny. J. Hered. 1934, 25, 273-274.
• Tezuka, T.; Kuboyama, T.; Matsuda, T.; Marubashi, W. Seven of eight species in Nicotiana section Suaveolentes have common factors leading to hybrid lethality in crosses with Nicotiana tabacum. Ann. Bot. 2010, 106, 267-276.
• Watanabe, H.; Marubashi, W. Temperature-dependent programmed cell death detected in hybrids between Nicotiana langsdorffii and N. tabacum expressing lethality. Plant Biotechnol. J. 2004, 21, 151-154.

タイトルに関連する用語 (6件)： 微細マッピング ,  トランスクリプトーム解析 ,  キャベツ ,  Brassica ,  雑種致死 ,  候補遺伝子