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J-GLOBAL ID:201902264630603432   整理番号:19A0789540

バイオ情報解析と実験的検証に基づく肝細胞癌における浸潤-転移関連マイクロRNAの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of invasion-metastasis-associated microRNAs in hepatocellular carcinoma based on bioinformatic analysis and experimental validation
著者 (30件):
資料名:
巻: 16  号:ページ: 266  発行年: 2018年 
JST資料番号: U7330A  ISSN: 1479-5876  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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肝細胞癌(HCC)は最も致死的な癌の1つであり,主に転移に対するその高い傾向に起因する。血管浸潤は,固形腫瘍転移のための直接経路を提供する。実装証拠は,マイクロRNA(miRNA)がヒト癌の発症と浸潤および転移を含む進行に関連することを示している。HCCにおける侵襲転移関連miRNAの検索において,マイクロアレイデータセットGSE67140を遺伝子発現Omnibusデータベースからダウンロードした。差次的に発現したmiRNA(DE-miRNA)はRソフトウェアパッケージにより得られ,潜在的標的遺伝子はmiRTarBaseにより予測された。アノテーション,可視化および統合発見(DAVID)のためのデータベースを,DE-miRNAのこれらの潜在的標的のための機能的アノテーションおよび経路濃縮分析を実行するために導入した。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークをSTRINGデータベースにより確立し,Cytosecapeソフトウェアにより可視化した。HCC細胞系の移動と浸潤に及ぼすmiR-494-3pとmiR-126-3pの影響を,創傷治癒分析とトランスウェルアッセイを実施することによって評価した。血管浸潤のないヒトHCC腫瘍と比較して,血管浸潤を伴うヒトHCC腫瘍において,57の上方制御miRNAと81の下方制御miRNAを含む合計138のDE-miRNAをスクリーニングした。上方3個の上方制御および下方制御miRNAの762個の標的遺伝子を予測し,それらは癌の経路,焦点接着およびMAPKシグナル伝達経路のようなHCC関連経路に関与していた。PPIネットワークにおいて,TP53とMYCのようなハブ遺伝子として,より高い程度のトップ10ハブノードを同定した。miRNA-ハブ遺伝子ネットワークを構築することにより,ほとんどのハブ遺伝子がmiR-494-3pおよびmiR-126-3pにより潜在的に調節され得ることを見出した。注目すべきことに,miR-494-3pおよびmiR-126-3pは,それぞれHCC細胞系および組織において著しく上方制御され,下方制御された。加えて,miR-494-3pの過剰発現はHCCの移動と浸潤を有意に促進し,miR-126-3pの過剰発現は反対の効果を発揮した。miR-494-3pおよびmiR-126-3pを標的とすることは,HCCの浸潤および転移を抑制するための効果的で有望なアプローチを提供する可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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細胞生理一般  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (34件):
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