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J-GLOBAL ID：201902264881065479   整理番号：19A1526918

サトウダイコン(Beta vulgaris L.)におけるBZR転写因子ファミリーのゲノムワイド同定,特性化および発現パターン【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification, characterization, and expression patterns of the BZR transcription factor family in sugar beet ( Beta vulgaris L.)

著者 (4件)： Wang Wei (Sugar Beet Physiological Research Institute, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot, China) ,  Sun Ya-Qing (Sugar Beet Physiological Research Institute, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot, China) ,  Li Guo-Long (Sugar Beet Physiological Research Institute, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot, China) ,  Zhang Shao-Ying (Sugar Beet Physiological Research Institute, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot, China)
資料名： BMC Plant Biology (Web)  (BMC Plant Biology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 191  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7027A  ISSN： 1471-2229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： BRASSINAZOLE-RESISTANT(BZR)ファミリー遺伝子はブラシノステロイドシグナル伝達に関与する植物特異的転写因子(TF)をコードする。BZR TFは細胞伸長を含む植物成長に重要な役割を持つ。しかし,サトウダイコン(Beta vulgaris L.)のBZR遺伝子についてはほとんど知られていない。そこで,サトウダイコンにおけるBvBZR遺伝子の全ゲノム研究を行った。BES1_N保存ドメインの分析を通して,6つのBvBZR遺伝子ファミリーメンバーを,系統発生分析に従って3つのサブグループにクラスタ化したサトウダイコンゲノムにおいて同定した。各クレードは保存されたモチーフにより良く定義され,密接な遺伝的関係が各サブファミリーのメンバー間で同定できることを意味した。染色体分布マッピングによると,2,1,1,1および1遺伝子はそれぞれ染色体1,4,5,6および8に位置していた。主根成長に関連するcis作用要素は,BvBZR遺伝子のプロモーター配列にランダムに分布していた。組織特異的発現分析により,全てのBvBZR遺伝子は3つの主要組織型(根,茎,葉)に発現し,葉において有意に高い発現を示した。細胞内局在分析は,BV1_FXREとBV6_nyuwが核に局在し,Wolf PSORTの予測と一致することを明らかにした。これらの知見は,サトウダイコンにおけるBZR遺伝子の機能を予測するための基礎を提供し,サトウダイコンにおけるBZR遺伝子の生物学的機能のさらなる研究の基礎を築く。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  遺伝 ,  細胞情報伝達 ,  プロモーター領域 ,  *ゲノム ,  *キャラクタリゼーション ,  植物成長 ,  *転写因子 ,  クラスタ化 ,  遺伝子
準シソーラス用語： 細胞内局在 ,  主根 ,  クレード ,  ドメイン構造 ,  *遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： BZR転写因子 ,  発現パターン ,  ゲノムワイド解析 ,  サトウダイコン ,  タプロットの開発

分類 (5件)： 植物ホルモン  (EH02070M) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  糖料作物  (FC03072N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  果樹  (FC03042G)

引用文献 (30件)：

• Li J, Chory J. A putative leucine-rich repeat receptor kinase involved in brassinosteroid signal transduction. Cell. 1997.https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)80357-8.
• Clouse SD. Molecular genetic studies confirm the role of brassinosteroids in plant growth and development. Plant J. 1996.https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1996.10010001.x.
• Kim MH, Kim Y, Kim JW, Lee HS, Lee WS, Kim SK, et al. Identification of Arabidopsis BAK1-associating receptor-like kinase 1 (BARK1) and characterization of its gene expression and brassinosteroidregulated root phenotypes. Plant Cell Physiol. 2013.https://doi.org/10.1093/pcp/pct106.
• Luo XM, Lin WH, Zhu SW, Zhu JY, Sun Y, Fan XY, et al. Integration of light- and brassinosteroidsignaling pathways by a GATA transcription factor in Arabidopsis. Dev Cell. 2010.https://doi.org/10.1016/j.devcel.2010.10.023.
• Friedrichsen DM, Joazeiro CA, Li J, Hunter T, Chory J. Brassinosteroid- insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase. Plant Physiol. 2000.https://doi.org/10.1104/pp.123.4.1247.

タイトルに関連する用語 (8件)： サトウダイコン ,  Beta ,  転写因子 ,  ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  特性化 ,  発現パターン