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J-GLOBAL ID：201902268771126287   整理番号：19A0625345

分子動力学シミュレーションによるβ2ミクログロブリン断片の三量体の構造解析【JST・京大機械翻訳】

Structural Analysis of a Trimer of β ₂-Microgloblin Fragment by Molecular Dynamics Simulations

著者 (10件)： Nishikawa Naohiro (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Nishikawa Naohiro (Department of Theoretical and Computational Molecular Science, Institute for Molecular Science, Okazaki, Aichi, Japan) ,  Sakae Yoshitake (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Gouda Takuya (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Tsujimura Yuichiro (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Okamoto Yuko (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Okamoto Yuko (Structural Biology Research Center, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Okamoto Yuko (Center for Computational Science, Graduate School of Engineering, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Okamoto Yuko (Information Technology Center, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan) ,  Okamoto Yuko (JST-CREST, Nagoya, Aichi, Japan)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 116  号： 5  ページ： 781-790  発行年： 2019年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： β2-ミクログロブリンの残基21から残基31へのフラグメントであるペプチドβ2-m21-31は,自己集合しアミロイド線維を形成することが実験的に知られている。アミロイド線維形成の機構を理解するために,著者らは,β2-m21-31の3つのフラグメントから成るシステムにレプリカ交換分子動力学法を適用した。温度依存性の解析から,ペプチドが互いに凝集する明確な相転移温度が存在することが分かった。さらに,2つの主要な安定状態が存在する自由エネルギー解析により,それらの一つはアミロイドフィブリルのようであり,他は非晶質凝集体であることを見出した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 非晶質 ,  凝集体 ,  *三量体 ,  *β2ミクログロブリン ,  ペプチド ,  *計算機シミュレーション ,  *構造解析 ,  温度依存性 ,  アミロイド ,  *分子動力学 ,  自由エネルギー ,  アミロイド線維 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *計算機利用 ,  *利用 ,  タンパク質 ,  糖タンパク質 ,  動物タンパク質
準シソーラス用語： フィブリル ,  レプリカ交換 ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 分子動力学シミュレーション ,  β2ミクログロブリン ,  断片 ,  三量体 ,  構造解析