Sequevar 14M Ralstonia solanacearum株HA4-1の完全ゲノム配列は水平遺伝子導入により獲得される新規III型エフェクターを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Tan Xiaodan; Tan Xiaodan; Tan Xiaodan; Qiu Huishan; Qiu Huishan; Qiu Huishan; Li Feng; Li Feng; Cheng Dong; Cheng Dong; Cheng Dong; Zheng Xueao; Zheng Xueao; Zheng Xueao; Wang Bingsen; Wang Bingsen; Wang Bingsen; Huang Mengshu; Huang Mengshu; Huang Mengshu; Li Wenhao; Li Wenhao; Li Wenhao; Li Yanping; Li Yanping; Li Yanping; Sang Kangqi; Song Botao; Song Botao; Song Botao; Du Juan; Du Juan; Du Juan; Chen Huilan; Chen Huilan; Chen Huilan; Xie Conghua; Xie Conghua

文献

J-GLOBAL ID：201902269611941287 整理番号：19A2242131

Sequevar 14M Ralstonia solanacearum株HA4-1の完全ゲノム配列は水平遺伝子導入により獲得される新規III型エフェクターを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Complete Genome Sequence of Sequevar 14M Ralstonia solanacearum Strain HA4-1 Reveals Novel Type III Effectors Acquired Through Horizontal Gene Transfer

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資料名：
巻： 10 ページ： 1893 発行年： 2019年
JST資料番号： U7080A ISSN： 1664-302X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

広い範囲の植物において細菌萎凋病を引き起こすRalstonia solanacearumは,その有意な遺伝的多様性のために「種複合体」と考えられている。最近,著者らは中国の湖北省におけるHong’an郡から新しいR.solanacearum株HA4-1を分離し,それが系統型I,後遺症14M(系統型I-14M)であることを同定した。興味深いことに,それが異なるジャガイモ遺伝子型の間で様々な疾患症状を引き起こし,系統発生的に関連した系統,GMI1000と比較して異なる病原性挙動を示すことを見出した。HA4-1の病原性機構を分析するために,Illina HiSeq2000,PacBio RS II,およびBAC末端配列決定を含む結合配列決定技術により全ゲノムを配列した。ゲノム集合結果は,HA4-1における143kbプラスミドと同様に,従来の染色体の存在を明らかにした。HA4-1とGMI1000の間の比較ゲノム解析は,分泌系,運動性,エキソ多糖類(EPS),および重要な調節因子のような一般的な病原性因子の高い保存を示すが,タイプIIIエフェクターのレパートリーと構造における有意な変異,それはある種のジャガイモ種または遺伝子型におけるそれらの特異的病因の決定因子である。著者らは,おそらく水平遺伝子移動(HGT)を通して獲得された2つの新しいタイプIIIエフェクターを同定した。これらの新しいR.solanacearumエフェクタは,いくつかのYopJおよびXopACファミリーメンバーと相同性を示す。RipBRとRipBSと命名した。特に,プラスミド上のRipBRのコピーは偽遺伝子であり,一方,メガapの他は正常である。RipBSについては,メガapとプラスミドに位置する3つのコピーがある。著者らの結果は,R.solanacearum種複合体のゲノム情報を,最初の配列14M株とR.solanacearumで報告された最大のプラスミドを配列決定することにより豊かにしただけでなく,III型エフェクタのレパートリーにおける変化も明らかにした。これは,R.solanacearumとジャガイモの間の病原性進化,宿主適応,および相互作用に関する将来の研究に大いに貢献する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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著者キーワード (5件)： , , , ,

微生物生理一般 , 微生物の生化学 , 遺伝子の構造と化学

引用文献 (92件)：

Ailloud F., Lowe T., Cellier G., Roche D., Allen C., Prior P. (2015). Comparative genomic analysis of Ralstonia solanacearum reveals candidate genes for host specificity. BMC Genomics 16:270. doi: 10.1186/s12864-015-1474-8
Al-Saadi A., Reddy J. D., Duan Y. P., Brunings A. M., Yuan Q., Gabriel D. W. (2007). All five host-range variants of Xanthomonas citri carry one pthA homolog with 17.5 repeats that determines pathogenicity on citrus, but none determine host-range variation. Mol. Plant Microbe Interact. 20 934-943. doi: 10.1094/MPMI-20-8-0934
Bertolla F., Frostegård Å, Brito B., Nesme X., Simonet P. (1999). During infection of its host, the plant pathogen Ralstonia solanacearum naturally develops a state of competence and exchanges genetic material. Mol. Plant Microbe Interact. 12 467-472. doi: 10.1094/MPMI.1999.12.5.467
Bocsanczy A. M., Espindola A. S., Norman D. J. (2019). Whole genome sequences of Ralstonia solanacearum strains P816, P822, and P824, emerging pathogens of blueberry in Florida. Microbiol. Resour. Announc. 8 e01316-18. doi: 10.1128/MRA.01316-8
Boucher C. A., Barberis P. A., Demery D. A. (1985). Transposon mutagenesis of Pseudomonas solanacearum: isolation of Tn5-induced avirulent mutants. Microbiology 131 2449-2457. doi: 10.1099/00221287-131-9-2449

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