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J-GLOBAL ID：201902271649143226   整理番号：19A2217649

Apo及びNADP+結合型におけるSulfolobus tokodaii株7由来の推定イソくえん酸デヒドロゲナーゼの結晶構造【JST・京大機械翻訳】

Crystal Structures of the Putative Isocitrate Dehydrogenase from Sulfolobus tokodaii Strain 7 in the Apo and NADP⁺-Bound Forms

著者 (2件)： Kondo Hisanori (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, 464-8602 Nagoya, Japan) ,  Murakami Midori (Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, 464-8602 Nagoya, Japan)
資料名： Archaea (Web)  (Archaea (Web))
巻： 2018  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7680A  ISSN： 1472-3646  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イソクエン酸デヒドロゲナーゼはトリカルボン酸サイクルの第3段階で作用する異化酵素である。古細菌Sulfolobus tokodaii由来の仮想蛋白質ST2166を単離し,結晶化した。それは原核生物NADP+依存性IDHと高い一次構造相同性を共有し,これらの酵素が一般的酵素機構を共有することを示唆した。ST2166の結晶構造はアポ型で2.0Å分解能で決定され,次いでNADP+で浸された結晶の構造は2.4Å解像度で決定され,推定活性部位にNADP+結合を含んだ。アポとNADP+結合型の構造と他の原核生物からのNADP-IDHとの比較は,原核生物NADP-IDHがドメイン閉鎖前の開口裂におけるST2166の保存Lys335,Tyr336及びArg386を用いてそれらの補因子を認識することを示唆した。Copyright 2018 Hisanori Kondo and Midori Murakami. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 古細菌 ,  原核生物 ,  相同性 ,  *イソクエン酸デヒドロゲナーゼ ,  *結晶構造 ,  分解能 ,  開口 ,  活性部位 ,  補因子 ,  酵素 ,  異化 ,  結晶化 ,  酵素反応機構
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  *Sulfolobus tokodaii , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (38件)：

• D. L. Nelson, M. M. Cox, "Reaction of the citric acid cycle," Lehninger’s Principles of Biochemistry, Fourth Edition, W.H. Freeman and Co., New York, NY, USA, 2017.
• J. H. Hurley, P. E. Thorsness, V. Ramalingam, N. H. Helmers, D. E. Koshland, R. M. Stroud, "Structure of a bacterial enzyme regulated by phosphorylation, isocitrate dehydrogenase," Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 86, no. 22, pp. 8635-8639, 1989.
• J. R. Cupp, L. McAlister-Henn, "NAD⁺-dependent isocitrate dehydrogenase. Cloning, nucleotide sequence, and disruption of the IDH2 gene from Saccharomyces cerevisiae," Journal of Biological Chemistry, vol. 266, no. 33, pp. 22199-22205, 1991.
• I. H. Steen, D. Madern, M. Karlström, T. Lien, R. Ladenstein, N. K. Birkeland, "Comparison of isocitrate dehydrogenase from three hyperthermophiles reveals differences in thermostability, cofactor specificity, oligomeric state, and phylogenetic affiliation," Journal of Biological Chemistry, vol. 276, no. 47, pp. 43924-43931, 2001.
• J. Finer-Moore, S. E. Tsutakawa, D. B. Cherbavaz, D. C. LaPorte, D. E. Koshland, R. M. Stroud, "Access to phosphorylation in isocitrate dehydrogenase may occur by domain shifting," Biochemistry, vol. 36, no. 45, pp. 13890-13896, 1997.

タイトルに関連する用語 (6件)： APO ,  Sulfolobus ,  株 ,  推定 ,  イソくえん酸デヒドロゲナーゼ ,  結晶構造