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J-GLOBAL ID：201902276417521215   整理番号：19A0886961

尿中の尿路上皮膀胱癌候補バイオマーカーの大規模SRMスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Large-Scale SRM Screen of Urothelial Bladder Cancer Candidate Biomarkers in Urine

著者 (18件)： Duriez Elodie (Genomics and Proteomics Research Unit, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health, Luxembourg) ,  Masselon Christophe D. (Univ. Grenoble Alpes, BIG-BGE, France) ,  Masselon Christophe D. (CEA, BIG-BGE, France) ,  Masselon Christophe D. (INSERM, BGE, France) ,  Mesmin Cedric (Genomics and Proteomics Research Unit, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health, Luxembourg) ,  Court Magali (Univ. Grenoble Alpes, BIG-BGE, France) ,  Court Magali (CEA, BIG-BGE, France) ,  Court Magali (INSERM, BGE, France) ,  Demeure Kevin (NorLux Neuro-Oncology Laboratory, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health (LIH), Luxembourg) ,  Allory Yves (INSERM, U955 Eq07, France) ,  Malats Nuria (Genetic and Molecular Epidemiology Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Spain) ,  Matondo Mariette (Department of Biology, Institute of Molecular Systems Biology, ETHZ, Switzerland) ,  Radvanyi Francois (Institut Curie, Centre de Recherche, France) ,  Radvanyi Francois (CNRS, UMR144, Equipe Oncologie Moleculaire, France) ,  Garin Jerome (Univ. Grenoble Alpes, BIG-BGE, France) ,  Garin Jerome (CEA, BIG-BGE, France) ,  Garin Jerome (INSERM, BGE, France) ,  Domon Bruno (Genomics and Proteomics Research Unit, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health, Luxembourg)
資料名： Journal of Proteome Research  (Journal of Proteome Research)
巻： 16  号： 4  ページ： 1617-1631  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1632A  ISSN： 1535-3893  CODEN： JPROBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿路上皮癌は,高い再発と実質的な罹患率と死亡率に関連する状態である。ぼうこう癌と腫瘍再発を検出する非侵襲的尿検査は,患者ケアを有意に改善するために必要である。過去10年にわたり,多数の膀胱癌候補バイオマーカーが,広範なプロテオミクスまたはトランスクリプトーム研究の文脈で同定されている。臨床的に有用なバイオマーカーにおけるこれらの知見を翻訳するために,これらの候補の系統的評価はボトルネックのままである。そのような評価は,単一分析における数千の遷移を監視することにより数百のシグネチャペプチドを標的とする大規模定量的LC-SRM(液体クロマトグラフィー選択反応モニタリング)測定を含む。高度に多重化されたSRM解析の設計は,スループット,ロバスト性,選択性および感度のいくつかの因子によって駆動される。分析される試料の複雑さのために,いくつかの測定(遷移)は,バイアスされたあるいは矛盾した推定ペプチド/蛋白質レベルをもたらす等圧化学種を共溶出することによって妨害される可能性がある。したがって,SRMデータの品質の評価は,これらの矛盾したデータをflagることを可能にするために重要である。生データの処理,低品質測定の検出,各蛋白質に対する信号の正規化,および蛋白質レベルの推定を含む,大きなSRMデータセットを処理するための効率的でロバストな方法について述べた。この方法論を用いて,膀胱癌と以前に関連する種々の蛋白質を,癌患者の大規模コホートからの尿試料の分析と,その後の臨床検証研究をガイドするための最も有望な候補の優先リストを確立する努力における対応する対照を通して評価した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： トランスクリプトーム ,  *バイオマーカー ,  品質 ,  多重化 ,  *スクリーニング ,  *膀胱腫瘍 ,  母集団 ,  ペプチド ,  タンパク質 ,  プロテオミクス ,  スループット ,  正規化 ,  検尿
準シソーラス用語： 患者介護 ,  非侵襲 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 質量分析 ,  標的プロテオミクス ,  大規模SRMスクリーン ,  候補バイオマーカー ,  膀胱癌 ,  尿 ,  非侵襲

分類 (2件)： 泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  腫ようの診断  (GE03020J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 尿 ,  尿路上皮 ,  膀胱癌 ,  バイオマーカー ,  大規模 ,  SRM ,  スクリーニング