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J-GLOBAL ID：201902278136079109   整理番号：19A1817314

2015~2018年のインドネシア,東ジャワにおける小児患者間のRotavirus感染の分子疫学と臨床的特徴:ウマ様から典型的なヒトG1/g3へのRotavirus遺伝子型における動的変化【JST・京大機械翻訳】

Molecular Epidemiology and Clinical Features of Rotavirus Infection Among Pediatric Patients in East Java, Indonesia During 2015-2018: Dynamic Changes in Rotavirus Genotypes From Equine-Like G3 to Typical Human G1/G3

著者 (25件)： Athiyyah Alpha Fardah (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Athiyyah Alpha Fardah (Department of Child Health, Soetomo Hospital, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Utsumi Takako (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Utsumi Takako (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Wahyuni Rury Mega (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Dinana Zayyin (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Yamani Laura Navika (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Soetjipto (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Sudarmo Subijanto Marto (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Sudarmo Subijanto Marto (Department of Child Health, Soetomo Hospital, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Ranuh Reza Gunadi (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Ranuh Reza Gunadi (Department of Child Health, Soetomo Hospital, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Darma Andy (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Darma Andy (Department of Child Health, Soetomo Hospital, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Juniastuti (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Raharjo Dadik (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Matsui Chieko (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Deng Lin (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Abe Takayuki (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Doan Yen Hai (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Fujii Yoshiki (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Shimizu Hiroyuki (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Laboratory of Viral Infection I, Department of Infection Control and Immunology, Kitasato Institute for Life Sciences and Graduate School of Infection Control Sciences, Kitasato University, Tokyo, Japan) ,  Lusida Maria Inge (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Shoji Ikuo (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 940  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： A群ロタウイルス(RVA)は世界中の小児における重症胃腸炎の最も重要な原因であり,有効なRVAワクチンは多くの国で導入されている。ここでは,2015~2018年にインドネシアの東ジャワの小児患者におけるRVA感染の分子疫学的解析を行った。急性胃腸炎の入院小児患者から合計432の糞便試料を収集した。このコホートにおける患者のどれも,RVAワクチンで免疫化されなかった。RVA感染の全体的罹患率は31.7%(137/432)であり,RVA感染は他の年齢群(P<0.05)におけるより6~11カ月齢群において有意により一般的であった。多重逆転写PCR(RT-PCR)により,最も一般的なG-P組合せはウマ様G3P[8](70.8%)であり,次いでウマ様G3P[6](12.4%),ヒトG1P[8](8.8%),G3P[6](1.5%),G1P[6](0.7%)であった。興味あることに,ウマ様株は2017年5月まで排他的に検出されたが,7月2017年7月には典型的なヒト遺伝子型(G1とG3)が完全に置換され,インドネシアのウマ様G3から典型的ヒトG1/G3への動的変化が低RVAワクチン被覆率の国でも起こり得ることを示唆した。RVA遺伝子型における動的変化の機構を探究する必要がある。RVA関連胃腸炎を有する乳児と小児は,いくつかの脱水,嘔吐,および水性下痢を伴って,より頻繁に提示され,非RVA胃腸炎と比較して,RVA感染のより大きな重症度を示している。結論として,動的変化は,ウマ様G3から典型的なヒト遺伝子型へのRVA遺伝子型で見出された。RVA感染症の重症例は一般的であり,特に6~11か月以上の小児において,2歳未満の小児において,RVAワクチン接種はインドネシアの国家免疫プログラムに含まれなければならない。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子型 ,  *ヒト ,  予防接種 ,  母集団 ,  ロタウイルス ,  乳児 ,  *インドネシア共和国 ,  感染症 ,  *ジャワ ,  ワクチン ,  *子供
準シソーラス用語： 胃腸炎 ,  *動的変化 ,  *Rotavirus ,  *患児 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ロタウイルス ,  ウマ様のg3 ,  典型的なヒト遺伝子型 ,  遺伝子型変化 ,  臨床的特徴 ,  インドネシア

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (43件)：

• Abou-Nader A. J., Sauer M. A., Steele A. D., Tate J. E., Atherly D., Parashar U. D., et al (2018). Global rotavirus vaccine introductions and coverage: 2006 - 2016. Hum. Vaccin. Immunother. 14 2281-2296. doi: 10.1080/21645515.2018.1470725
• Arana A., Montes M., Jere K. C., Alkorta M., Iturriza-Gomara M., Cilla G. (2016). Emergence and spread of G3P[8] rotaviruses possessing an equine-like VP7 and a DS-1-like genetic backbone in the Basque Country (North of Spain), 2015. Infect. Genet. Evol. 44 137-144. doi: 10.1016/j.meegid.2016.06.048
• Cowley D., Donato C. M., Roczo-Farkas S., Kirkwood C. D. (2016). Emergence of a novel equine-like G3P[8] inter-genogroup reassortant rotavirus strain associated with gastroenteritis in Australian children. J. Gen. Virol. 97 403-410. doi: 10.1099/jgv.0.000352
• Doan Y. H., Suzuki Y., Fujii Y., Haga K., Fujimoto A., Takai-Todaka R., et al (2017). Complex reassortment events of unusual G9P[4] rotavirus strains in India between 2011 and 2013. Infect. Genet. Evol. 54 417-428. doi: 10.1016/j.meegid.2017.07.025
• Dóró R., Laszlo B., Martella V., Leshem E., Gentsch J., Parashar U., et al (2014). Review of global rotavirus strain prevalence data from six years post vaccine licensure surveillance: is there evidence of strain selection from vaccine pressure? Infect. Genet. Evol. 28 446-461. doi: 10.1016/j.meegid.2014.08.017

タイトルに関連する用語 (11件)： インドネシア ,  ジャワ ,  小児患者 ,  Rotavirus ,  感染 ,  分子疫学 ,  臨床的特徴 ,  ウマ ,  ヒト ,  遺伝子型 ,  動的変化