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J-GLOBAL ID：201902279273526848   整理番号：19A0710466

メチル化ゲノム情報の組込みは薬物治療応答の予測精度を改善する【JST・京大機械翻訳】

Incorporating methylation genome information improves prediction accuracy for drug treatment responses

著者 (14件)： Xia Xiaoxuan (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Xia Xiaoxuan (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Weng Haoyi (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Weng Haoyi (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Men Ruoting (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Men Ruoting (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Sun Rui (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Sun Rui (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Zee Benny Chung Ying (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Zee Benny Chung Ying (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Chong Ka Chun (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Chong Ka Chun (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China) ,  Wang Maggie Haitian (Division of Biostatistics, Centre for Clinical Research and Biostatistics, JC School of Public Health and Primary Care, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong, China) ,  Wang Maggie Haitian (CUHK Shenzhen Research Institute, Shenzhen, China)
資料名： BMC Genetics (Web)  (BMC Genetics (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 78  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7366A  ISSN： 1471-2156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 証拠の蓄積は,ヒト疾患の病因を説明する後成的因子の重要な役割を明らかにした。いくつかの経験的研究は,疾患予測のためのモデルにメチル化データを成功裏に組み込んだ。しかし,異なるタイプのオミクスデータを予測モデルに統合することは依然として課題であり,予測に対するメチル化情報の寄与は完全に明らかにされていない。人工神経回路網に基づいて層別化薬物応答予測モデルを構築し,フェノフィブラート介入後の循環トリグリセリド濃度の変化を予測した。関連する一塩基多型(SNP),選択したシトシン-ホスファート-グアニン(CpG)部位のメチル化,年齢,性および喫煙状態を予測因子として含めた。選択されたSNPによるモデルは,43.65%の平均5倍の交差検証予測誤差率を達成した。モデルにメチル化情報を加えた後,誤差率は41.92%に低下した。有意なSNP,CpG部位,年齢,性および喫煙状態の組合せは,41.54%の最低予測誤差率を達成した。SNPデータだけを用いることと比較して,予測モデルにおけるメチル化データの追加は,誤差率をわずかに改善した。さらなる予測誤差減少は,ゲノム,メチル化ゲノム,および環境因子の組合せによって達成される。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *予測 ,  病因 ,  *ゲノム ,  予測モデル ,  *メチル化 ,  *薬物療法 ,  喫煙 ,  一塩基多型 ,  リン酸塩 ,  層別 ,  予測誤差
準シソーラス用語： 予測因子 ,  CpG ,  オミックス ,  *予測精度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： メチル化 ,  予測 ,  SNPs ,  ニューラルネットワーク ,  治療反応

分類 (1件)： 牛  (FD02020Y)

引用文献 (27件)：

• Drugs Pharm Sci; Pharmacoepigenetics: from basic epigenetics to therapeutic applications; J Flanagan, A Petronis; 156; 2005; 461; 10.1201/9780849359507.ch20; citation_id=CR1
• Cancer Investig; Utility of gene promoter methylation in prediction of response to platinum-based chemotherapy in epithelial ovarian cancer (EOC); P Chaudhry, R Srinivasan, FD Patel; 27; 8; 2009; 877-884; 10.1080/07357900902849699; citation_id=CR2
• Eur Urol Suppl; Diagnosis and prediction of recurrent bladder cancer by urinary DNA methylation analysis: multicenter prospective study; T Shindo, T Shimizu, N Nishiyama, T Niinuma, H Kitajima, M Kai, N Shinkai, N Itoh, T Tanaka, H Suzuki; 16; 3; 2017; e206-e208; 10.1016/S1569-9056(17)30191-4; citation_id=CR3
• Nat Rev Genet; DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges; H Heyn, M Esteller; 13; 10; 2012; 679-692; 10.1038/nrg3270; citation_id=CR4
• Blood; Quantitative DNA methylation predicts survival in adult acute myeloid leukemia; L Bullinger, M Ehrich, K Döhner, RF Schlenk, H Döhner, MR Nelson, D van den Boom; 115; 3; 2010; 636-642; 10.1182/blood-2009-03-211003; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： メチル化 ,  ゲノム情報 ,  組込み ,  薬物治療 ,  応答 ,  予測精度