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J-GLOBAL ID：201902280013738296   整理番号：19A1478604

CHI3L1の発現低下を調節するシス-EQTL対立遺伝子は日本人コホートにおける遅発性成人喘息と関連する【JST・京大機械翻訳】

A cis-eQTL allele regulating reduced expression of CHI3L1 is associated with late-onset adult asthma in Japanese cohorts

著者 (15件)： Kanazawa Jun (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Kitazawa Haruna (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Masuko Hironori (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Yatagai Yohei (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Sakamoto Tohru (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Kaneko Yoshiko (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Iijima Hiroaki (Tsukuba Medical Center, Ibaraki, Japan) ,  Naito Takashi (Tsukuba Medical Center, Ibaraki, Japan) ,  Saito Takefumi (National Hospital Organization Ibaraki Higashi National Hospital, Ibaraki, Japan) ,  Noguchi Emiko (Department of Medical Genetics, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Konno Satoshi (Department of Respiratory Medicine, Faculty of Medicine and Graduate School of Medicine, Hokkaido University, Sapporo, Japan) ,  Nishimura Masaharu (Department of Respiratory Medicine, Faculty of Medicine and Graduate School of Medicine, Hokkaido University, Sapporo, Japan) ,  Hirota Tomomitsu (Research Center for Medical Science, The Jikei University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Tamari Mayumi (Research Center for Medical Science, The Jikei University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hizawa Nobuyuki (Department of Pulmonary Medicine, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan)
資料名： BMC Medical Genetics (Web)  (BMC Medical Genetics (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 58  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7307A  ISSN： 1471-2350  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キチナーゼ様蛋白質YKL-40はinflamマソームの阻害に主要な役割を果たしている。喘息患者における病理学的気道炎症の重要な調節因子としてinflamマソーム活性化の調節解除が出現している。YKL-40,キチナーゼ3様1(CHI3L1)をコードする遺伝子のcis発現量的形質遺伝子座(eQTL)が喘息の発症または特異的喘息表現型に関与するかどうかを決定した。日本の筑波大学で実施されたこの症例対照研究は,筑波全ゲノム関連研究(GWAS)コホート(健常ボランティア734名,喘息患者237名),筑波複製コホート(健常成人ボランティア375名,成人喘息患者381名),および北海道複製コホート(健常成人ボランティア554名,成人喘息患者428名)を対象とした。肺におけるCHI3L1における34のcis-eQTLの間で,rs946261はこれらの日本のコホートにおける成人喘息と関連していた。喘息に対するrs946261の遺伝的影響も,発症年齢と成人喘息クラスターにより検討した。筑波GWASコホートにおいて,rs946261におけるC対立遺伝子は,肺におけるCHI3L1mRNAの発現の減少および喘息の発生と有意に関連していた(オッズ比(OR)1.27;P=0.036)。また,3つの日本のコホート(OR1.16;P=0.013)の分析後に,関連性も観察された。41歳以上で発症した遅発性喘息(OR1.24;95%信頼区間(CI)1.07-1.45;P=0.0058)と後期発症,低アトピー性および軽度気流閉塞(OR1.29;95%CI1.03-1.61;P=0.027)により特徴付けられる特異的喘息表現型を伴うより強い相関が見られた。CHI3L1の発現を低下させるcis-eQTL対立遺伝子から成る遺伝子型は,遅発性成人喘息と特異的に関連していた。細胞増殖,遊走,走化性,再編成および組織リモデリングを含む多くの病態生理学的過程におけるYKL-40の重要な役割を考えると,喘息気道における炎症およびリモデリングの確立における重要な病原性役割に関与している可能性がある。著者らの知見は,遅発性成人喘息の病因におけるYKL-40の活性化に関連する特異的エンド型の存在を示す可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細胞増殖 ,  キチナーゼ ,  *対立遺伝子 ,  表現型 ,  気道 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  炎症 ,  *喘息 ,  遺伝子型 ,  *母集団 ,  病因 ,  ボランティア
準シソーラス用語： リモデリング ,  *成人気管支喘息 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： キチナーゼ3様1(CHI3L1) ,  YKL-40 ,  発現量的形質遺伝子座(Eqtls) ,  喘息 ,  遺伝学 ,  遅発性成人喘息

分類 (5件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般  (GD04010C) ,  循環系の疾患  (GJ03000C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (39件)：

• Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol; Differential expression of chitinases identify subsets of murine airway epithelial cells in allergic inflammation; RJ Homer, Z Zhu, L Cohn, CG Lee, WI White, S Chen; 291; 2006; L502-L511; 10.1152/ajplung.00364.2005; citation_id=CR1
• Allergy Asthma Immunol Res; Role of breast regression protein-39/YKL-40 in asthma and allergic responses; CG Lee, JA Elias; 2; 2010; 20-27; 10.4168/aair.2010.2.1.20; citation_id=CR2
• J Infect Dis; YKL-40, a matrix protein of specific granules in neutrophils, is elevated in serum of patients with community-acquired pneumonia requiring hospitalization; C Nordenbaek, JS Johansen, P Junker, N Borregaard, O Sørensen, PA Price; 180; 1999; 1722-1726; 10.1086/315050; citation_id=CR3
• Cell Host Microbe; Chitinase 3-like-1 promotes Streptococcus pneumoniae killing and augments host tolerance to lung antibacterial responses; CS Cruz, W Liu, CH He, A Jacoby, A Gornitzky, B Ma; 12; 2012; 34-46; 10.1016/j.chom.2012.05.017; citation_id=CR4
• N Engl J Med; A chitinase-like protein in the lung and circulation of patients with severe asthma; GL Chupp, CG Lee, N Jarjour, YM Shim, CT Holm, S He; 357; 2007; 2016-2027; 10.1056/NEJMoa073600; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： 発現 ,  調節 ,  eQTL ,  対立遺伝子 ,  日本人 ,  コホート ,  遅発性 ,  成人喘息