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J-GLOBAL ID：201902283517642521   整理番号：19A1884101

小角散乱プロファイルからの抗体の粗視化モデリング【JST・京大機械翻訳】

Coarse-Grained Modeling of Antibodies from Small-Angle Scattering Profiles

著者 (12件)： Corbett Daniel (School of Chemical Engineering and Analytical Science, The University of Manchester, U.K.) ,  Hebditch Max (School of Chemical Engineering and Analytical Science, The University of Manchester, U.K.) ,  Keeling Rose (School of Chemical Engineering and Analytical Science, The University of Manchester, U.K.) ,  Ke Peng (Formulation Sciences, MedImmune Ltd, U.K.) ,  Ekizoglou Sofia (Formulation Sciences, MedImmune Ltd, U.K.) ,  Sarangapani Prasad (Regeneron Pharmaceuticals, New York, United States) ,  Pathak Jai (Vaccine Research Center, National Institute of Health, Maryland, United States) ,  Van Der Walle Christopher F. (Formulation Sciences, MedImmune Ltd, U.K.) ,  Uddin Shahid (Formulation Sciences, MedImmune Ltd, U.K.) ,  Baldock Clair (Division of Cell Matrix Biology and Regenerative Medicine, The University of Manchester, U.K.) ,  Avendano Carlos (School of Chemical Engineering and Analytical Science, The University of Manchester, U.K.) ,  Curtis Robin A. (School of Chemical Engineering and Analytical Science, The University of Manchester, U.K.)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 35  ページ： 8276-8290  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： モノクローナル抗体に対する濃縮溶液挙動の予測は,それらの形状と相互作用ポテンシャルを記述するための最小モデルの開発と使用を必要とする。この目的のために,モノクローナル抗体(COE-03)に対する小角X線散乱(SAXS)プロファイルを,弱い自己会合を生成するために選択した溶液条件下で測定した。実験はビーズ間引力の有無にかかわらず3ビーズ抗体モデルの分子シミュレーションにより補完した。散乱プロファイルを分子シミュレーションから直接抽出し,デカップリング近似を用いて避けた。著者らは,散乱プロファイルの特徴と蛋白質濃度に対する圧縮性の依存性を捉えるために,3ビーズモデルの能力を調べた。3ビーズモデルは,抗体の平面構造の結果である明確な肩を含む波動ベクトルS(k)の関数として実験構造因子の一般的特徴を再現でき,k~0.025Å-1のS(k)で明確な最小値を示した。また,デカップリング近似は高度に異方的な形状を説明できないことを示した。シミュレートされた散乱プロファイルに対するマッチング球状モデルから得られた最良適合パラメータは,蛋白質濃度依存性であり,熱力学的性質を予測するためのそれらの適用性を制限する。それにもかかわらず,実験的圧縮性曲線はBaxter接着モデルの適切なパラメータ化により正確に再現でき,モデルが抗体に対する半経験的状態方程式を提供することを示した。これらの結果は,それらの異方性形状を説明することによって,どのように状態方程式が抗体に対して改善されるかについての洞察を提供する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  *抗体 ,  曲線 ,  モノクローナル抗体 ,  濃度依存性 ,  状態方程式 ,  異方性 ,  近似法 ,  粒状材 ,  パラメタリゼーション ,  *散乱 ,  デカップリング ,  *モデリング ,  小角X線散乱
準シソーラス用語： *粗視化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 抗原・抗体・補体の生化学  (ED04020L) ,  抗原・抗体・補体一般  (ED04010A)

タイトルに関連する用語 (5件)： 小角散乱 ,  プロファイル ,  抗体 ,  粗視化 ,  モデリング