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J-GLOBAL ID：201902284331168547   整理番号：19A0711680

複雑な構造変異を有するB型肝炎ウイルスの特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of hepatitis B virus with complex structural variations

著者 (5件)： Fujiwara Kei (Department of Gastroenterology and Metabolism, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences, Nagoya, Japan) ,  Matsuura Kentaro (Department of Gastroenterology and Metabolism, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences, Nagoya, Japan) ,  Matsunami Kayoko (Department of Gastroenterology and Metabolism, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences, Nagoya, Japan) ,  Iio Etsuko (Department of Gastroenterology and Metabolism, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences, Nagoya, Japan) ,  Nojiri Shunsuke (Department of Gastroenterology and Metabolism, Nagoya City University Graduate School of Medical Sciences, Nagoya, Japan)
資料名： BMC Microbiology (Web)  (BMC Microbiology (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 202  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7367A  ISSN： 1471-2180  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： B型肝炎ウイルス(HBV)感染は最も重大な公衆衛生問題の1つである。最近のHBV遺伝学的研究は,挿入,欠失および重複のようなSVの組合せから成る複雑な構造変化(SV)と呼ばれる新しい遺伝的再編成を明らかにした。HBVの複雑なSVに対する広範な探索を行い,それらの特性を分析した。複雑なSVを有する55のHBV株を,生物情報学的ツールを用いてHBVの遺伝的配列を分析することによって同定した。以前の報告における複雑なSVを有する15のHBV株と共に,複雑なSVを有する合計70のHBV株を分析した。HBVゲノムにおける複雑なSVは,しばしばnt1500と2000の間に位置した。挿入は,複雑なSVを有するHBV株の65/70(92.9%)で観察された。挿入モチーフ配列として,肝細胞核因子1結合部位,エンハンサーIIにおけるボックスαの一部に相補的な配列,および未知の起源の挿入が観察された。複合SVは6つの群に分類され,挿入と欠失の組合せは他のパターンより頻繁に観察された。HBV配列の広範な探索を通して,複雑なSVを有する新しい株を本研究で同定した。複雑なSVを有するHBVの特性を,複雑なSVを有する70のHBV株の分析によって明らかにした。HBV関連肝疾患の病因におけるその役割を解明するためにさらなる研究が必要である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 公衆衛生 ,  ゲノム ,  *B型肝炎ウイルス ,  遺伝子再編成 ,  結合部位 ,  遺伝 ,  肝臓疾患 ,  病因 ,  再編成 ,  *キャラクタリゼーション ,  *変異
準シソーラス用語： 肝細胞核因子1 ,  バイオインフォマティクス ,  構造変化 ,  遺伝学研究 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： B型肝炎ウイルス ,  遺伝子再配列 ,  複雑な構造変化 ,  肝細胞核因子1結合部位

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (38件)：

• Hepatitis B; 2017; citation_id=CR1
• Liver Int; Stopping long-term treatment with nucleos(t)ide analogues is a favourable option for selected patients with HBeAg-negative chronic hepatitis B; F Bommel, T Berg; 38; Suppl 1; 2018; 90-96; 10.1111/liv.13654; citation_id=CR2
• J Gen Virol; Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes; H Okamoto, F Tsuda, H Sakugawa, RI Sastrosoewignjo, M Imai, Y Miyakawa, M Mayumi; 69; Pt 10; 1988; 2575-2583; 10.1099/0022-1317-69-10-2575; citation_id=CR3
• Cold Spring Harb Perspect Med; Origins and evolution of hepatitis B virus and hepatitis D virus; M Littlejohn, S Locarnini, L Yuen; 6; 2016; a021360; 10.1101/cshperspect.a021360; citation_id=CR4
• Virology; Complete genomes, phylogenetic relatedness, and structural proteins of six strains of the hepatitis B virus, four of which represent two new genotypes; H Norder, AM Courouce, LO Magnius; 198; 1994; 489-503; 10.1006/viro.1994.1060; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (3件)： 変異 ,  B型肝炎ウイルス ,  特性化