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J-GLOBAL ID：201902284372313633   整理番号：19A1410975

細菌L-アラビノース1-デヒドロゲナーゼの触媒および基質認識機構への構造的洞察【JST・京大機械翻訳】

Structural insights into the catalytic and substrate recognition mechanisms of bacterial l-arabinose 1-dehydrogenase

著者 (8件)： Watanabe Yasunori (Department of Bioscience, Graduate School of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Yasunori (Faculty of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Iga Chinatsu (Faculty of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Yasuo (Department of Bioscience, Graduate School of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Yasuo (Faculty of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Seiya (Department of Bioscience, Graduate School of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Seiya (Faculty of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Watanabe Seiya (Center for Marine Environmental Studies (CMES), Ehime University, Matsuyama, Japan)
資料名： FEBS Letters  (FEBS Letters)
巻： 593  号： 11  ページ： 1257-1266  発行年： 2019年 
JST資料番号： D0575A  ISSN： 0014-5793  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Azospirillum brasilenseにおいて,グラム陰性窒素固定細菌,L-アラビノースは非りん酸化代謝経路を通してα-ケトグルタル酸に変換される。経路における第一段階において,L-アラビノースは,グルコース-フルクトースオキシドレダクターゼ/イノシトールデヒドロゲナーゼ/リゾピン異化蛋白質(Gfo/Idh/MocA)ファミリーに属するNAD(P)依存性L-アラビノース1-デヒドロゲナーゼ(AraDH)によりL-アラビノ-γ-ラクトンに酸化される。ここでは,それぞれ1.5および2.2Å解像度でアポおよびNADP結合AraDHの結晶構造を決定した。L-アラビノース及びNADP結合AraDHのドッキングモデル及び構造に基づく変異解析はLys91又はAsp169が触媒塩基として作用し,Glu147,His153及びAsn173が基質認識に関与することを示唆した。特に,Asn173はL-アラビノースとD-キシロース,L-アラビノースのC4エピマーの間の識別において役割を果たしている可能性がある。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  *デヒドロゲナーゼ ,  ドッキング ,  結晶構造 ,  *細菌 ,  異化 ,  リン酸化 ,  エピマ ,  分解能 ,  *触媒 ,  代謝経路 ,  脂肪族ケトン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ケト酸 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： Azospirillum brasilense ,  *基質認識 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 結晶構造 ,  L-アラビノース1-デヒドロゲナーゼ ,  L-アラビノース代謝

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (2件)： α-ケトグルタル酸 ,  L-アラビノース

タイトルに関連する用語 (6件)： 細菌 ,  L-アラビノース ,  デヒドロゲナーゼ ,  触媒 ,  基質認識 ,  洞察