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J-GLOBAL ID：201902285424028682   整理番号：19A1477914

異質四倍体Brassica napusにおけるWuschel関連ホメオボックス(WOX)遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と解析は倍数化中のWOX遺伝子の変化を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification and analysis of the WUSCHEL -related homeobox ( WOX ) gene family in allotetraploid Brassica napus reveals changes in WOX genes during polyploidization

著者 (5件)： Li Mengdi (State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China) ,  Wang Ruihua (State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China) ,  Liu Zhengyi (State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China) ,  Wu Xiaoming (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of CAAS, Wuhan, China) ,  Wang Jianbo (State Key Laboratory of Hybrid Rice, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 317  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物特異的ホメオボックス(HB)転写因子をコードするWUSCHEL-RELATEDホメオボックス(WOX)遺伝子は,植物の成長と発達において重要な役割を果たしている。今日まで,WOX遺伝子は多くの倍数体(ワタやタバコのような)で同定され,分析されてきたが,倍数体化の間のそれらの進化分析はまれである。ゲノム配列決定の完了により,異質四倍体Brassica napusおよびその二倍体前駆体(B.rapaおよびB.oleracea)はこの問題を研究するための良いシステムである。本研究において,52,25及び29のWOX遺伝子を異質四倍体B.napus(2n=4x=38,AnCN),AnゲノムドナーB.rapa(2n=2x=20,Ar)及びCnゲノムドナーB.oleracea(2n=2x=18,Co)において同定した。B.napusおよびその二倍体前駆細胞におけるすべての同定されたWOX遺伝子を3つのクレードに分割し,これらの遺伝子を遺伝子構造および染色体位置分析を実行するために選択した。結果は,少なくとも70と67%のWOX遺伝子が染色体上の同じ遺伝子構造と相対位置を維持し,B.napusのWOX遺伝子が倍数化の間にDNAレベルで高度に保存されていることを示した。加えて,WOX遺伝子の近くの重複遺伝子と転移性要素(TE)の分析は,全ゲノム三倍化(WGT)イベント,セグメント重複および豊富なTEがB.napusにおけるWOX遺伝子ファミリーの拡大において重要な役割を果たすことを示した。さらに,進化的関係を持つWOX遺伝子対の発現プロファイルの解析は,WOX遺伝子ファミリーが倍数体化の間に転写調節レベルで変化する可能性を示唆した。本研究の結果は,B.napusおよびその二倍体前駆細胞におけるWOX遺伝子の理解を増加させ,これらの種におけるWOX遺伝子のさらなる研究のための豊富な資源を提供する。さらに,倍数化の過程の間のWOX遺伝子の変化を,遺伝子数,遺伝子構造,遺伝子相対位置および遺伝子発現の観点から考察し,将来の倍数化分析のための参照を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  染色体 ,  タバコ ,  *四倍体 ,  *アブラナ属 ,  二倍体 ,  *ホメオボックス遺伝子 ,  *ゲノム ,  倍数体 ,  転写因子 ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： クレード ,  *倍数体化 ,  *遺伝子ファミリー ,  *Brassica napus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Wuschel関連ホメオボックス遺伝子 ,  WOX遺伝子ファミリー ,  ホメオボックスドメイン ,  異質四倍体 ,  Brassica napus ,  倍数化 ,  発現パターン

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (70件)：

• Annu Rev Biochem; Homeodomain proteins; WJ Gehring, M Affolter, T Burglin; 63; 1994; 487-526; 10.1146/annurev.bi.63.070194.002415; citation_id=CR1
• Genome Biol; The WUS homeobox-containing (WOX) protein family; E Graaff, T Laux, SA Rensing; 10; 2009; 248; 10.1186/gb-2009-10-12-248; citation_id=CR2
• Sci World J; Origins and evolution of WUSCHEL-related homeobox protein family in plant kingdom; G Lian, Z Ding, Q Wang, D Zhang, J Xu; 2014; 2014; 534140; 10.1155/2014/534140; citation_id=CR3
• Mol Biol Evol; A comprehensive classification and evolutionary analysis of plant homeobox genes; K Mukherjee, L Brocchieri, TR Burglin; 26; 2009; 2775-2794; 10.1093/molbev/msp201; citation_id=CR4
• BMC Plant Biol; Genome-wide analysis of WOX genes in upland cotton and their expression pattern under different stresses; Z Yang, Q Gong, W Qin, Z Yang, Y Cheng, L Lu; 17; 2017; 113; 10.1186/s12870-017-1065-8; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： Brassica ,  ホメオボックス ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  解析 ,  倍数化