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J-GLOBAL ID：201902286678819329   整理番号：19A2730969

LC-MS/MSを用いた包括的DNAメチル化定量化の集約的最適化と評価【JST・京大機械翻訳】

Intensive optimization and evaluation of global DNA methylation quantification using LC-MS/MS

著者 (5件)： Nakagawa Terumichi (Department of Laboratory Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Wakui Masatoshi (Department of Laboratory Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hayashida Tetsu (Department of Surgery, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Nishime Chiyoko (Central Institute for Experimental Animals, Kawasaki, Japan) ,  Murata Mitsuru (Department of Laboratory Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 411  号： 27  ページ： 7221-7231  発行年： 2019年 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化は典型的な後成的現象である。全DNAメチル化レベルを検出するための多数の方法が開発されており,その中でLC-MS/MSが感度,再現性およびコストの観点から優れた方法として出現している。しかし,LC-MS/MS法は実験室アッセイに必要な安定性と標準化の欠如により限界がある。本研究は,グローバルDNAメチル化レベルの高精度測定を保証するロバストなアッセイを確立することを目的とした。開発した方法の少なくとも3つのファセットがある。第一はナトリウム付加物を最小化するための溶媒条件の発見である。2番目は,以前の類似の研究では使用されていなかったカラムを用いたLCによるヌクレオシドの分離の改善である。3番目は測定結果の不確実性の減少に成功し,それはmdCの比率を用いた較正によって達成されたが,内部標準の存在における絶対量ではなかった。これらのファセットは以前に報告された方法よりも有利である。著者らの開発した方法は,1つの分析に対して短い時間(8分)でDNAメチル化の定量化を可能にし,5%未満の日間CV%によって表される測定の再現性が高い。加えて,培養細胞系における全体的DNAメチル化レベルの測定から得られたデータは,薬理学的脱メチル化の有無にかかわらず,生物医学研究への利用を支持する。このアッセイは,種々の細胞における後成的変化または収差の初期スクリーニングを行うことを可能にすると期待される。Copyright 2019 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 収差 ,  *最適化 ,  培養細胞 ,  脱メチル ,  *集中化 ,  ヌクレオシド ,  再現性 ,  ファセット ,  標準化 ,  ナトリウム ,  薬理学 ,  スクリーニング ,  ロバスト性 ,  *DNAメチル化 ,  *液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析 ,  *改変
準シソーラス用語： *LC/MS/MS , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： LC-MS/MS ,  DNAメチル化 ,  測定不確実性 ,  ヌクレオシド ,  最適化

分類 (1件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J)

タイトルに関連する用語 (6件)： LC-MS ,  DNAメチル化 ,  定量化 ,  集約 ,  最適化 ,  評価