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J-GLOBAL ID：201902288452928038   整理番号：19A2675505

CodonバイアスはヒトmRNAに対する安定性を付与する【JST・京大機械翻訳】

Codon bias confers stability to human mRNAs

著者 (16件)： Hia Fabian (Department of Medical Chemistry, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Yang Sheng Fan (Department of Medical Chemistry, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Shichino Yuichi (RNA Systems Biochemistry Laboratory, RIKEN Cluster for Pioneering Research, Wako, Japan) ,  Yoshinaga Masanori (Department of Medical Chemistry, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Murakawa Yasuhiro (Division of Genomic Technologies, RIKEN Center for Life Science Technologies, Yokohama, Japan) ,  Murakawa Yasuhiro (RIKEN Preventive Medicine and Diagnosis Innovation Program, Yokohama, Japan) ,  Vandenbon Alexis (Laboratory of Infection and Prevention, Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Fukao Akira (Laboratory of Biochemistry, Department of Pharmacy, Kindai University, Higashiosaka City, Japan) ,  Fujiwara Toshinobu (Laboratory of Biochemistry, Department of Pharmacy, Kindai University, Higashiosaka City, Japan) ,  Landthaler Markus (RNA Biology and Posttranscriptional Regulation, Max Delbrueck Center for Molecular Medicine Berlin, Berlin Institute for Molecular Systems Biology, Berlin, Germany) ,  Landthaler Markus (IRI Life Sciences, Institut fuer Biologie, Humboldt-Universitaet zu Berlin, Berlin, Germany) ,  Natsume Tohru (Molecular Profiling Research Center for Drug Discovery (molprof), National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tokyo, Japan) ,  Adachi Shungo (Molecular Profiling Research Center for Drug Discovery (molprof), National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tokyo, Japan) ,  Iwasaki Shintaro (RNA Systems Biochemistry Laboratory, RIKEN Cluster for Pioneering Research, Wako, Japan) ,  Iwasaki Shintaro (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa, Japan) ,  Takeuchi Osamu (Department of Medical Chemistry, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Kyoto, Japan)
資料名： EMBO Reports  (EMBO Reports)
巻： 20  号： 11  ページ： e48220  発行年： 2019年 
JST資料番号： W1261A  ISSN： 1469-221X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Codonバイアスは,いくつかのモデル生物におけるmRNA安定性に寄与する主要因子の1つとして関連づけられている。しかしながら,mRNA安定性に対するコドンバイアスの分子機構は,ヒトでは不明のままである。ここでは,ヒト細胞がユニークなコドンバイアスを介しRNA安定性を調節する機構を有することを示した。バイオインフォマティクス解析により,コドンは3番目の塩基位置(GC3)でGまたはCを持つ2つの異なるグループ-コドン,3番目の塩基位置(AT3)でAまたはTを持つコドンにクラスター化できることを示した。コドンバイアスの定量化は,GC3含有量の増加が比例的に高いGC含有量を伴うことを示した。バイオインフォマティクス,リボソームプロファイリングおよびin vitro分析により,コドンバイアスの影響を分離することにより,2つのモードのmRNA調節,1つのGCおよび1つのGC含有量依存性が明らかになることを示した。免疫沈降に基づく戦略を用いて,コドンバイアスに基づいて全体的なmRNA量を特異的に調節するRNA結合蛋白質としてILF2とILF3を同定した。著者らの結果は,コドンバイアスがmRNA豊度を支配する2つの発音系であることを示す。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヒト ,  *バイアス ,  免疫沈降反応 ,  *mRNA ,  in vitro実験 ,  コドン ,  クラスタ化 ,  リボソーム ,  RNA結合タンパク質
準シソーラス用語： プロファイリング ,  バイオインフォマティクス ,  RNA安定性 ,  コドンバイアス ,  mRNA安定性 ,  *Codon , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コドンバイアス ,  コドン最適性 ,  GC含有量 ,  mRNA安定性 ,  翻訳効率

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB04020F)

タイトルに関連する用語 (4件)： バイアス ,  ヒト ,  mRNA ,  安定性