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J-GLOBAL ID：201902288512216068   整理番号：19A1287141

チトクロームP450 3A4で検出された4つのMajorチャンネル:その多特異性を理解するためのステップ【JST・京大機械翻訳】

Four Major Channels Detected in the Cytochrome P450 3A4: A Step toward Understanding Its Multispecificity

著者 (7件)： Benkaidali Lydia (Laboratoire de Biochimie Theorique, CNRS UPR 9080, Institut de Biologie Physico-Chimique, 75005 Paris, France) ,  Andre Francois (CEA/I2BC, CNRS UMR 9198, Universite Paris Saclay, 91190 Gif-sur-Yvette, France) ,  Moroy Gautier (MTi, INSERM UMR-S 973, Universite Paris Diderot, 75013 Paris, France) ,  Tangour Bahoueddine (Unite de Recherche de Modelisation en Sciences Fondamentales et Didactique, BP244, Universite de Tunis El Manar, 2092 Tunis, Tunisie) ,  Maurel Francois (ITODYS, CNRS UMR 7086, Universite Paris Diderot, 75013 Paris, France) ,  Petitjean Michel (MTi, INSERM UMR-S 973, Universite Paris Diderot, 75013 Paris, France) ,  Petitjean Michel (E-pole de Genoinformatique, CNRS UMR 7592, Institut Jacques Monod, 75013 Paris, France)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 20  号： 4  ページ： 987  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質データバンク(PDB)から抽出した16の結晶構造に基づいてチトクロームP450(CYP)の3A4アイソフォームのチャンネルのネットワークを計算した。本研究プロジェクトで開発したCCCPPソフトウェアのバージョン2を用いて計算を行った。埋め込まれた活性サイトにアクセスする可能な方法としてCCCPPによる最小コスト経路(MCPs)出力を同定した。本論文では,MCPsの計算アルゴリズムを,チャネルの可視化の独自の方法を用いて提示した。これらのMCPsはCYP3A4において4つの主要チャンネルを構成することを見出した。2007年にCojocaruらによって提案された多くのチャネルの中で,それらのうちの4つだけが3A4に開いていることを見出した。これらのチャネルの精密な記述を,関連する定量的データと共に提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ソフトウェア ,  活性部位 ,  *チトクロームP450 ,  ネットワーク ,  *チャネル ,  結晶構造 ,  可視化
準シソーラス用語： 情報へのアクセス ,  計算アルゴリズム ,  アイソフォーム ,  蛋白質データベース ,  *特異性 ,  *Major ,  チトクロームP450 3A4 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： チトクロームP450 ,  CYP3A4 ,  アクティブサイトアクセスチャネル ,  空洞境界 ,  最小コストパス

分類 (4件)： 害虫に対する農薬  (FB06020U) ,  酵素生理  (EJ02020P) ,  昆虫・ダニによる植物被害  (FC04072U) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (94件)：

• Estabrook, R.W. A passion for P450s (remembrances of the early history of research on cytochrome P450). Drug. Metab. Disp. 2003, 31, 1461-1473.
• Omura, T. Recollection of the early years of the research on cytochrome P450. Proc. Jpn. Acad. Ser. B 2011, 87, 617-640.
• [Green Version] Guengerich, F.P. New trends in cytochrome P450 research at the half-century mark. J. Biol. Chem. 2013, 288, 17063-17064.
• Nelson, D.R. Cytochrome P450 diversity in the tree of life. Biochim. Biophys. Acta Proteins Proteom. 2018, 1886, 141-154.
• Guengerich, F.P.; Rendic, S. Update information on drug metabolism systems-2009, Part I. Curr. Drug. Metab. 2010, 11, 1-3.

タイトルに関連する用語 (4件)： チトクロームP450 ,  チャンネル ,  特異性 ,  理解