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J-GLOBAL ID：201902289294234121   整理番号：19A1817864

二重RNA-seqはEpinephelus coioidesとの宿主-病原体相互作用中にPseudomonas plecoglosicida htpG遺伝子機能を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Dual RNA-Seq Unveils Pseudomonas plecoglossicida htpG Gene Functions During Host-Pathogen Interactions With Epinephelus coioides

著者 (8件)： Huang Lixing (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Zhao Lingmin (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Liu Wenjia (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Xu Xiaojin (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Su Yongquan (State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde, China) ,  Qin Yingxue (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Yan Qingpi (Key Laboratory of Healthy Mariculture for the East China Sea, Fisheries College, Jimei University, Ministry of Agriculture, Xiamen, China) ,  Yan Qingpi (State Key Laboratory of Large Yellow Croaker Breeding, Ningde, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 10  ページ： 984  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Pseudomonas plecogossicidaは,魚の様々な病気に関連する温度依存性日和見病原体である。「白色結節」病の発生の間,P.plecogossicidaにおけるhtpGの発現は,18°Cのその毒性温度で有意に上方制御されることがわかった。htpG-RNAi株の感染は,Epinephelusコイオイドの脾臓における発症時間遅れ,死亡率の減少および感染症状をもたらし,細菌組織コロニー形成に影響を及ぼした。P.plecogossicidaの病原性調節に及ぼすP.plecogossicidaのhtpGサイレンシングの影響を明らかにするために,二重RNA-seqを実行し,病原体-宿主統合ネットワークを構築した。著者らの結果は,感染が免疫応答に関連する宿主遺伝子の発現を誘導するが,細菌の病原性遺伝子の発現を減弱させることを示した。宿主免疫遺伝子と細菌の病原性遺伝子の間に新しい統合が見られたが,IL6,IL1R2,IL1BおよびTLR5はネットワークにおいて重要な役割を果たした。GeneMANIAによる更なる分析は,FlgDとRPLFがhtpG依存性毒性調節の間に重要な役割を果たす可能性があることを示した。それはhtpG-RNAi株における生物膜生産,運動性,および病原性の減少と一致した。一方,IL6とIL1BはP.plecoglossicidaに対する防御の間に重要な役割を果たすことが分かった。一方,celA2,TRY,CPA1,CPA2,およびcpb1は宿主に攻撃するP.plecoglossicidaの重要な標的であった。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *病原体 ,  *RNA【核酸】 ,  細菌 ,  病原性 ,  死亡率 ,  遺伝子サイレンシング ,  インターロイキン6 ,  *遺伝子 ,  *Pseudomonas ,  脾臓 ,  RNA干渉 ,  免疫反応
準シソーラス用語： *Epinephelus ,  *チャイロマルハタ ,  *RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 病原体-宿主分子統合 ,  二重RNA-seq ,  Pseudomonas plecoglosicida ,  Epinephelus Coioides ,  HTPG

分類 (1件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

引用文献 (64件)：

• Nishimori E, Kita-Tsukamoto K, Wakabayashi H. Pseudomonas plecoglossicida sp. nov., the causative agent of bacterial hemorrhagic ascites of ayu, Plecoglossus altivelis. Int J Syst Evol Microbiol. (2000) 50:83-9. doi: 10.1099/00207713-50-1-83
• Hu J, Zhang F, Xu XJ, Su YQ, Qin YX, Ma Y, et al. Isolation, identification and virulence of the pathogen of white-spots disease in internal organs of Pseudosciaena crocea. Oceanol Limnol Sin. (2014) 45:409-417. doi: 10.1099/00207713-50-1-83
• Zhang B, Luo G, Zhao L, Huang L, Qin Y, Su Y, et al. Integration of RNAi and RNA-seq uncovers the immune responses of Epinephelus coioides to L321_RS19110 gene of Pseudomonas plecoglossicida. Fish Shellfish Immunol. (2018) 81:121-9. doi: 10.1016/j.fsi.2018.06.051
• Akayli T, Canak O, Basaran B. A new Pseudomonas species observed in cultured young rainbow trout. (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792): Pseudomonas plecoglossicida. Res J Biol Sci. (2011) 4:107-11. doi: 10.1016/j.fsi.2018.06.051
• Sun Y, Luo G, Zhao L, Huang L, Qin Y, Su Y, et al. Integration of RNAi and RNA-seq reveals the immune responses of Epinephelus coioides to sigX gene of Pseudomonas plecoglossicida. Front Immunol. (2018) 9:1624. doi: 10.3389/fimmu.2018.01624

タイトルに関連する用語 (6件)： RNA-seq ,  Epinephelus ,  宿主-病原体相互作用 ,  Pseudomonas ,  HtpG ,  遺伝子機能