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J-GLOBAL ID：201902290082070563   整理番号：19A1817469

成熟および若いブドウ園におけるブドウ台木遺伝子型に関連した真菌および細菌根圏ミクロビオーム【JST・京大機械翻訳】

The Fungal and Bacterial Rhizosphere Microbiome Associated With Grapevine Rootstock Genotypes in Mature and Young Vineyards

著者 (7件)： Berlanas Carmen (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas - Universidad de la Rioja - Gobierno de La Rioja, Logrono, Spain) ,  Berbegal Monica (Instituto Agroforestal Mediterraneo, Universitat Politecnica de Valencia, Valencia, Spain) ,  Elena Georgina (Instituto Agroforestal Mediterraneo, Universitat Politecnica de Valencia, Valencia, Spain) ,  Laidani Meriem (Instituto Agroforestal Mediterraneo, Universitat Politecnica de Valencia, Valencia, Spain) ,  Cibriain Jose Felix (EVENA, Seccion de Viticultura y Enologia del Gobierno de Navarra, Olite, Spain) ,  Saguees Ana (EVENA, Seccion de Viticultura y Enologia del Gobierno de Navarra, Olite, Spain) ,  Gramaje David (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino, Consejo Superior de Investigaciones Cientificas - Universidad de la Rioja - Gobierno de La Rioja, Logrono, Spain)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1142  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 根圏と内圏にコロニーを形成する微生物相は,植物成長,生産性,炭素隔離,およびファイトレメディエーションに寄与する。いくつかの研究は,異なる植物タイプと同じ植物種の遺伝子型が部分的に異なる微生物を持つことを示唆した。ここでは,2つのブドウ園で同じ土壌で栽培された5つのブドウの台木遺伝子型を通して,根圏細菌と菌類の微生物相を特性化し,16S rRNA遺伝子とITSハイスループット・アンプリコン配列決定によって2年間にわたって試料採取を行った。加えて,定量的PCR(qPCR)アプローチを用いて,黒足病に関連する真菌病原体の相対存在量と動的変化を測定した。その目的は,(1)ブドウの根圏における微生物群集に及ぼす台木遺伝子型の影響を明らかにし,(2)黒足病病原体の配列読み取りとDNA量の相対的存在量を比較することであった。成熟ブドウ園の根圏において,微生物の宿主遺伝的制御が明らかであった。ミクロビオーム組成もサンプリングの年にシフトし,菌類の多様性はサンプリングモーメントにより変化した。線形判別分析により,ブドウの台木と関連した特異的細菌(すなわち,Bacillus)および菌類(すなわちGlomus)分類群を同定した。宿主遺伝子型は,若いブドウ園における根圏α-およびβ-多様性のいかなる要約指標も予測しなかった。黒足関連病原体に関しては,配列決定とqPCRの間に有意な相関が観察された。結論として,成熟ブドウ園におけるブドウの台木遺伝子型は異なる根圏微生物と関連していた。後者はブドウ園の年齢,土壌特性または圃場管理実施により影響を受けた。根株の微生物選択の原因とブドウがそれらの関連微生物群集を形成できる機構を解読するために,より包括的な研究が必要である。根圏における細菌と菌類の広大な多様性と微生物相とブドウの間の相互作用を理解することは,ブドウの保護のための将来の戦略の開発を容易にするであろう。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *根圏 ,  DNA【核酸】 ,  キャラクタリゼーション ,  桿菌属 ,  微生物 ,  *遺伝子型 ,  相互作用 ,  ミクロフローラ ,  *ブドウ ,  コロニー ,  植物成長 ,  病原体 ,  *台木
準シソーラス用語： アンプリコン ,  *ブドウ園 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 細菌と真菌の動員 ,  黒足病 ,  微生物生態学 ,  ミクロビオーム ,  根圏 ,  台木選択

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (106件)：

• Abarenkov K., Nilsson R. H., Larsson K. H., Alexander I. J., Eberhardt U., Erland S., et al (2010). The UNITE database for molecular identification of fungi - recent updates and future perspectives. New Phytol. 186 281-285. doi: 10.1111/j.1469-8137.2009.03160.x
• Agustí-Brisach C., Armengol J. (2013). Black-foot disease of grapevine: an update on taxonomy, epidemiology and management strategies. Phytopathol. Mediterr. 52 245-261. doi: 10.14601/Phytopathol_Mediterr-12662
• Agustí-Brisach C., Mostert L., Armengol J. (2014). Detection and quantification of Ilyonectria spp. associated with black-foot disease of grapevine in nursery soils using multiplex nested PCR and quantitative PCR. Plant Pathol. 63 316-322. doi: 10.1111/ppa.12093
• Aira M., Gómez-Brandón M., Lazcano C., Bååth E., Domínguez J. (2010). Plant genotype strongly modifies the structure and growth of maize rhizosphere microbial communities. Soil Biol. Biochem. 42 2276-2281. doi: 10.1016/j.soilbio.2010.08.029
• Alaniz S., García-Jiménez J., Abad-Campos P., Armengol J. (2010). Susceptibility of grapevine rootstocks to Cylindrocarpon liriodendri and C. macrodidymum. Sci. Hortic. 125 305-308. doi: 10.1016/j.scienta.2010.04.009

タイトルに関連する用語 (9件)： 成熟 ,  ブドウ園 ,  ブドウ ,  台木 ,  遺伝子型 ,  真菌 ,  細菌 ,  根圏 ,  ミクロビオーム