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J-GLOBAL ID：201902290242369974   整理番号：19A1883645

RNAテトラループと尿素との平衡変性と優先的相互作用【JST・京大機械翻訳】

Equilibrium Denaturation and Preferential Interactions of an RNA Tetraloop with Urea

著者 (3件)： Miner Jacob C. (Theoretical Biology and Biophysics, Los Alamos National Laboratory, New Mexico, United States) ,  Miner Jacob C. (Center for Nonlinear Studies, CNLS, MS B258, Los Alamos National Laboratory, New Mexico, United States) ,  Garcia Angel E. (Center for Nonlinear Studies, CNLS, MS B258, Los Alamos National Laboratory, New Mexico, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 15  ページ： 3734-3746  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿素は,細胞における浸透圧ストレスを維持し,折畳まれた生体分子の集合を特異的に安定化することにおいて意味を持つ重要な有機共溶質である。非バイアスレプリカ交換分子動力学による超安定RNAテトラループの尿素誘導変性の平衡研究を報告した。折畳み状態の不安定化に加えて,尿素は特異的立体配置を不安定化し,RNA核酸塩基との好ましい相互作用を形成することによりRNA自由エネルギー景観を平滑化することを見出した。自由エネルギー(m値)の線形濃度依存性を観測し,他のRNAヘアピン及び蛋白質の結果と一致した。さらに,RNA内の水素結合とスタッキング相互作用の分析は主に温度依存性を示すが,RNAと尿素間の相互作用は主に濃度依存性を示す。著者らの知見はRNA折畳みに及ぼす尿素の影響に関する価値ある洞察を提供し,溶液化学の機能としての塩基性RNAヘアピンの熱力学を記述する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  熱力学 ,  分子動力学 ,  *RNA【核酸】 ,  自由エネルギー ,  濃度依存性 ,  折畳み ,  溶質 ,  *相互作用 ,  温度依存性 ,  バイアス ,  水素結合 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： 不安定化 ,  生体分子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： 尿素

タイトルに関連する用語 (8件)： RNA ,  テトラ ,  ループ ,  尿素 ,  平衡 ,  変性 ,  優先 ,  相互作用