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J-GLOBAL ID：201902290377034884   整理番号：19A2026287

RNA-seqは子宮内膜癌におけるIGSF9の過剰発現を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

RNA-seq Reveals the Overexpression of IGSF9 in Endometrial Cancer

著者 (12件)： Shi Zonggao ( Harper Cancer Research Institute, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Shi Zonggao ( Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Li Chunyan ( Harper Cancer Research Institute, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Li Chunyan ( Department of Gynecology and Obstetrics, Shandong Provincial Hospital Affiliated to Shandong University, Jinan, Shandong Province, China) ,  Tarwater Laura ( Harper Cancer Research Institute, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Li Jun ( Department of Applied and Computational Mathematics and Statistics, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Li Yang ( Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Kaliney William ( Harper Cancer Research Institute, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Kaliney William ( Department of Pathology, The Medical Foundation, South Bend, IN 46601, USA) ,  Chandrashekar Darshan S. ( Department of Pathology, University of Alabama School of Medicine, Birmingham, AL 35294, USA) ,  Stack M. Sharon ( Harper Cancer Research Institute, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA) ,  Stack M. Sharon ( Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, South Bend, IN 46617, USA)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2018  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍組織と隣接する非癌組織の両方が利用可能な子宮内膜癌の7人の患者に対し,Illinaプラットフォーム上でRNA-seqを行った。合計66の遺伝子は,調整したp値<0.01で有意水準で差別的に発現した。NIH DAVIDバイオインフォーマティクス資源における遺伝子機能分類ツールを用いて,5つの遺伝子が遺伝子のリストのうちの唯一の富化グループであることがわかった。遺伝子IGSF9をヒト子宮内膜癌組織のより大きなコホートの免疫組織化学的染色によるさらなる特性化のために選択した。癌細胞におけるIGSF9の発現レベルは,同じ患者([数式:原文を参照])または癌と対照([数式:原文を参照])の間の全体的な比較における対組織標本における対照腺細胞におけるそれより有意に高かった。IGSF9発現は,浸潤のない患者([数式:原文を参照])と比較して子宮筋層浸潤患者で高い。癌ゲノムAtlasからのRNA-seqデータセットの再解析は,子宮内膜癌対正常対照におけるIGSF9のより高い発現を示し,発現は予後不良と関連していた。これらの結果は,子宮内膜癌における新しいバイオマーカーとしてのIGSF9を示唆し,その機能,作用機序および潜在的臨床的有用性に関するさらなる研究を正当化する。Copyright 2018 Zonggao Shi et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *子宮内膜癌 ,  腫瘍細胞 ,  遺伝子 ,  キャラクタリゼーション ,  ヒト ,  母集団 ,  浸潤 ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： 予後不良 ,  バイオインフォマティクス ,  差別 ,  p値 ,  腫瘍組織 ,  *過剰発現 ,  *RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 女性生殖器と胎児の腫よう  (GS04000K)

引用文献 (30件)：

• J. C. Marioni, C. E. Mason, S. M. Mane, M. Stephens, Y. Gilad, "RNA-seq: an assessment of technical reproducibility and comparison with gene expression arrays," Genome Research, vol. 18, no. 9, pp. 1509-1517, 2008.
• K. Tomczak, P. Czerwińska, M. Wiznerowicz, "The Cancer Genome Atlas (TCGA): An immeasurable source of knowledge," Wspolczesna Onkologia, vol. 1A, pp. A68-A77, 2015.
• L. Chin, W. C. Hahn, G. Getz, M. Meyerson, "Making sense of cancer genomic data," Genes & Development, vol. 25, no. 6, pp. 534-555, 2011.
• C. International Cancer, T. J. Genome, W. Anderson, "International network of cancer genome projects, Nature," Proceedings of the International network of cancer genome projects, Nature, vol. 464, pp. 993, 2010.
• M. Le Gallo, A. J. O'Hara, M. L. Rudd, M. E. Urick, N. F. Hansen, N. J. O'Neil, J. C. Price, S. Zhang, B. M. England, A. K. Godwin, D. C. Sgroi, P. Hieter, J. C. Mullikin, M. J. Merino, D. W. Bell, "Exome sequencing of serous endometrial tumors identifies recurrent somatic mutations in chromatin-remodeling and ubiquitin ligase complex genes," Nature Genetics, vol. 44, no. 12, pp. 1310-1315, 2012.

タイトルに関連する用語 (3件)： RNA-seq ,  子宮内膜癌 ,  過剰発現