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J-GLOBAL ID:201902297440222759   整理番号:19A1902709

分子動力学シミュレーションにより研究したカリキサレンナノカプセルの温度依存性機械的変性【JST・京大機械翻訳】

Temperature dependent mechanical unfolding of calixarene nanocapsules studied by molecular dynamics simulations
著者 (5件):
資料名:
巻: 151  号:ページ: 045102-045102-10  発行年: 2019年 
JST資料番号: C0275A  ISSN: 0021-9606  CODEN: JCPSA6  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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原子論的分子動力学シミュレーションを用いて,インターロックされたカリキサレンカプセルの二量体であるモデル超分子錯体の機械的非折畳みの温度依存性を研究した。この系は水素結合の異なるネットワークにより安定化された二つの立体配座間の可逆的遷移を示した。温度の関数としてこれらのネットワークの強制解離と形成を研究し,システムを機械的に引っ張ることにより課せられた非平衡条件の強い影響を見出した。2つの立体配座の間の遷移の動力学は,実験的またはシミュレーションデータから得られた力に依存する速度論的速度の解析に用いられる確率モデルの妥当性の範囲を調べるのに理想的に適している。これらのモデルは通常,関連する遷移に対する活性化動力学を仮定し,したがって,速度論的速度に対する解析式はArrhenius型である。シミュレーションによる温度と力に依存する動力学の研究は,いかなるモデル仮定もなしで遷移速度の解析を可能にする。速度の温度依存性は,力の各値に対するArrhenius則により良く記述されることを見出した。これにより,相互に独立な力の関数として,活性化自由エネルギーと裸の運動速度を決定することができる。一般的なモデル仮定と一致して,活性化自由エネルギーは力の増加と共に減少することを見出した。裸の速度の力依存性は低力領域におけるモデル計算の結果と互換性があり,高い力では偏差が観察された。Copyright 2019 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
分類
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高分子の立体構造  ,  分子構造  ,  ペプチド 
タイトルに関連する用語 (4件):
タイトルに関連する用語
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