特許

J-GLOBAL ID：201903003369270895

トランスクリプトーム推定装置およびトランスクリプトーム推定方法

発明者： 若本 祐一 ,  小林 鉱石
出願人/特許権者： 国立大学法人 東京大学
代理人 (1件)： 特許業務法人アイテック国際特許事務所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2017-234164
公開番号（公開出願番号）：特開2019-097520
出願日： 2017年12月06日
公開日（公表日）： 2019年06月24日
要約：

【課題】細胞を破壊することなく短時間に細胞のトランスクリプトームを推定する。【解決手段】所定波長のレーザ光を対象細胞に照射し、その反射光や散乱光などの検出光のうちストークス光のみを選別し、ストークス光を分光してラマン散乱スペクトルを得る。そして、ラマン散乱スペクトルに基づいて対象細胞のトランスクリプトームを推定する。この際、ラマン散乱スペクトルをN次元のN次元ラマンデータに次元圧縮し、N次元ラマンデータに基づいて対象細胞のトランスクリプトームを推定するのが好ましい。対象細胞にレーザ光を照射するだけでよいから、対象細胞を破壊する必要がない。この結果、細胞を破壊することなく短時間に細胞のトランスクリプトームを推定することができる。【選択図】図1

請求項（抜粋）：

対象細胞のトランスクリプトームを推定するトランスクリプトーム推定装置であって、 所定波長のレーザ光を前記対象細胞に照射するレーザ照射手段と、 前記レーザ光の照射に対する反射光や散乱光などの検出光のうちストークス光のみを選別する光選別手段と、 前記選別されたストークス光を分光してラマン散乱スペクトルを出力する分光手段と、 前記ラマン散乱スペクトルに基づいて前記対象細胞のトランスクリプトームを推定する推定手段と、 を備えるトランスクリプトーム推定装置。

IPC (3件)：

C12M 1/34 ,  G01N 21/65 ,  C12Q 1/04

FI (3件)：

C12M1/34 A ,  G01N21/65 ,  C12Q1/04

Fターム (28件)：

2G043AA06 ,  2G043BA16 ,  2G043CA04 ,  2G043DA08 ,  2G043EA03 ,  2G043FA02 ,  2G043FA06 ,  2G043HA01 ,  2G043HA02 ,  2G043HA09 ,  2G043HA15 ,  2G043JA02 ,  2G043JA03 ,  2G043JA04 ,  2G043KA02 ,  2G043KA05 ,  2G043KA09 ,  2G043LA03 ,  2G043NA01 ,  2G043NA02 ,  4B029AA07 ,  4B029BB01 ,  4B029FA12 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ52 ,  4B063QX01

引用文献：

審査官引用 (4件)

• 生物物理, 20170728, Vol.57, No.4, p208-211
• 生物物理 第54回年会予稿集, 20161125, Vol.56 Supplement1-2, s277, 2Pos301
• 生物物理, Vol.60, No.2, p108-110
• Cell systems, 20180725, Vol.7, p104-117