特許

J-GLOBAL ID：201903008649120939

システイン反応性プローブとその使用

発明者： クラバット,ベンジャミン エフ. ,  バッカス,ケリアン エム. ,  コレイア,ブルーノ イー. ,  ブルーエット,メーガン エム. ,  テイジャロ,ジョン アール.
出願人/特許権者： ザ・スクリップス・リサーチ・インスティテュート
代理人 (1件)： 清原 義博
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2018-516113
公開番号（公開出願番号）：特表2019-501363
出願日： 2016年10月21日
公開日（公表日）： 2019年01月17日
要約：

システイン含有タンパク質を、小分子断片の結合標的であると同定するための方法、組成物、プローブ、ポリペプチド、アッセイ、およびキットが本明細書に開示されている。さらに、タンパク質上の生物学的に活性なシステイン部位をマッピングし、および、システイン含有タンパク質との相互作用のために小分子断片をスクリーニングするための方法、組成物、およびプローブも本明細書で開示されている。【選択図】図1

請求項（抜粋）：

システイン含有タンパク質を、小分子断片の結合標的であると同定する方法であって、 該方法は、 (a)小分子断片とシステイン反応性プローブで処理された第1の細胞溶液を含むサンプルからシステイン反応性プローブ-タンパク質複合体のセットを得る工程であって、システイン反応性プローブが、システイン含有タンパク質上に位置するシステイン残基と共有結合を形成することができる反応性部分を含む、工程と、 (b)プロテオミクス解析手段によってシステイン反応性プローブ-タンパク質複合体のセットを解析する工程と、 (c)工程(b)に基づいて、システイン含有タンパク質を、小分子断片の結合標的であると同定する工程を含む、方法。

IPC (9件)：

G01N 33/68 ,  G01N 33/50 ,  G01N 33/15 ,  C12N 9/04 ,  C12N 9/50 ,  C12N 9/10 ,  C12Q 1/32 ,  C12Q 1/37 ,  C12Q 1/48

FI (9件)：

G01N33/68 ,  G01N33/50 Z ,  G01N33/15 Z ,  C12N9/04 Z ,  C12N9/50 ,  C12N9/10 ,  C12Q1/32 ,  C12Q1/37 ,  C12Q1/48 Z

Fターム (60件)：

2G045AA13 ,  2G045AA24 ,  2G045AA25 ,  2G045AA26 ,  2G045AA29 ,  2G045AA40 ,  2G045BA13 ,  2G045BA14 ,  2G045BB20 ,  2G045BB24 ,  2G045CA01 ,  2G045CA18 ,  2G045CA23 ,  2G045CA25 ,  2G045CB01 ,  2G045CB02 ,  2G045CB03 ,  2G045CB07 ,  2G045CB08 ,  2G045CB11 ,  2G045CB12 ,  2G045CB14 ,  2G045CB17 ,  2G045CB19 ,  2G045CB21 ,  2G045DA14 ,  2G045DA20 ,  2G045DA36 ,  2G045FA16 ,  2G045FA34 ,  2G045FA37 ,  2G045FB01 ,  2G045FB02 ,  2G045FB03 ,  2G045FB08 ,  2G045FB12 ,  2G045FB13 ,  2G045FB15 ,  2G045GC10 ,  2G045GC12 ,  2G045GC15 ,  4B050CC03 ,  4B050DD11 ,  4B050GG01 ,  4B050LL03 ,  4B063QA18 ,  4B063QA20 ,  4B063QQ24 ,  4B063QQ26 ,  4B063QQ36 ,  4B063QQ79 ,  4B063QR04 ,  4B063QR06 ,  4B063QR16 ,  4B063QR48 ,  4B063QR55 ,  4B063QS32 ,  4B063QS36 ,  4B063QX01 ,  4B063QX02

引用特許：

出願人引用 (2件)

• 抗菌薬としてのベータ-ラクトン類
  公報種別：公表公報   出願番号：特願2010-547983   出願人：ルートヴィヒ-マクシミリアンズ-ウニヴェルジテート・ミュンヘン
• カスパーゼ-8の結晶、モデルおよび方法
  公報種別：公表公報   出願番号：特願2001-503629   出願人：ファルマシア・アンド・アップジョン・カンパニー

審査官引用 (2件)

• 抗菌薬としてのベータ-ラクトン類
  公報種別：公表公報   出願番号：特願2010-547983   出願人：ルートヴィヒ-マクシミリアンズ-ウニヴェルジテート・ミュンヘン
• カスパーゼ-8の結晶、モデルおよび方法
  公報種別：公表公報   出願番号：特願2001-503629   出願人：ファルマシア・アンド・アップジョン・カンパニー

引用文献：

出願人引用 (2件)

• Proteome-wide profiling of targets of cysteine reactive small molecules by using ethynyl benziodoxol
• Quantitative reactivity profiling predicts functional cysteines in proteomes

審査官引用 (2件)

• Proteome-wide profiling of targets of cysteine reactive small molecules by using ethynyl benziodoxol
• Quantitative reactivity profiling predicts functional cysteines in proteomes