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J-GLOBAL ID：202002210500457105   整理番号：20A2334675

ゲノム特性は地理的に分布したDehalococcoidiaを区別する【JST・京大機械翻訳】

Genomic Characteristics Distinguish Geographically Distributed Dehalococcoidia

著者 (5件)： Yang Yi (Key Laboratory of Pollution Ecology and Environmental Engineering, Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shenyang, China) ,  Zhang Yaozhi (Key Laboratory of Pollution Ecology and Environmental Engineering, Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shenyang, China) ,  Zhang Yaozhi (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Capiro Natalie L. (Department of Civil and Environmental Engineering, Auburn University, Auburn, AL, United States) ,  Yan Jun (Key Laboratory of Pollution Ecology and Environmental Engineering, Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shenyang, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 546063  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Dehalocococcidia(Dia)クラス微生物は,種々の原生および汚染環境においてしばしば見られる。メタゲノム集合ゲノム(MAG)と単一細胞増幅ゲノム(SAG)研究は,Dia微生物生態学と進化の理解を大きく改善した。しかし,地理的に異なる環境に分布するDia微生物のゲノムおよび進化特性に関する最新の徹底的な調査が実施されていない。本研究では,Diaの進化と代謝形質を解明するために利用可能なゲノムデータを分析した。67のゲノムから検索された16S rRNA遺伝子の系統発生に基づいて,Dia微生物は,すべてのDehalococcoidesとDehalogenimonas株,海洋クラスタI,および海洋クラスタIIを含む陸生クラスターの3つの群に分類できる。これらの結果は,Dia陸上クラスタと比較して,Dia海洋クラスタにおいて水平移動遺伝物質の高い比率を見出した。パンゲノム分析は,Dia微生物がクラスター特異的酵素(例えば,陸生Diaにおけるデハロゲナーゼ,海洋Diaにおける亜硫酸塩レダクターゼ)および生合成能力(例えば,海洋Diaにおけるシロヘム生合成)を進化させることを示唆する。海洋Dia微生物は,有機ハロゲン化物呼吸以外のエネルギー保存のための多用途代謝に適応している。海洋と陸生Dia間のゲノムの違いは,様々な環境におけるDiaの生理学と進化を解明するために,学際的アプローチを必要とする元素循環(例えば,炭素,硫黄,塩素)における明確な機能と役割を示唆する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  炭素 ,  亜硫酸塩 ,  遺伝 ,  海洋 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  硫黄 ,  陸地 ,  レダクターゼ
準シソーラス用語： デハロゲナーゼ ,  Dehalococcoides ,  メタゲノム ,  陸生 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Dehalococcoidia ,  ゲノム比較 ,  進化 ,  時間ツリー ,  還元的デハロゲナーゼ

分類 (5件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (67件)：

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• ArkinA. P.CottinghamR. W.HenryC. S.HarrisN. L.StevensR. L.MaslovS. (2018). KBase: the United States department of energy systems biology knowledgebase. Nat. Biotechnol. 36 566-569.

タイトルに関連する用語 (3件)： ゲノム ,  地理 ,  分布