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J-GLOBAL ID：202002213100093619   整理番号：20A2512065

早期大腸癌発生モデルにおいて急速に増殖する細胞状態を緩徐に増殖させるマスターレギュレータを同定するためのシステム生物学アプローチ【JST・京大機械翻訳】

A Systems Biology Approach to Identifying a Master Regulator That Can Transform the Fast Growing Cellular State to a Slowly Growing One in Early Colorectal Cancer Development Model

著者 (6件)： Choi Jihye (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea) ,  Gong Jeong-Ryeol (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea) ,  Hwang Chae Young (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea) ,  Joung Chang Young (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea) ,  Lee Soobeom (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea) ,  Cho Kwang-Hyun (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon, South Korea)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 570546  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は,その発生に沿った遺伝子変異を特性化するために最も広く研究されている。しかし,著者らは,その観察と分析の限られた手段によるCRC開始の乏しい理解をまだ有している。CRC開始事象を明らかにすることができるならば,早期癌検出と予防のための新規予後マーカーと治療標的を同定する可能性がある。この問題に取り組むため,初期CRC開発モデルを確立し,その単一細胞RNA配列決定データのトランスクリプトーム解析を行う。興味深いことに,著者らは2つのサブタイプ,異なる成長速度と遺伝子シグネチャのゆっくりと成長する個体群を見出し,急速に成長するサブタイプ細胞の細胞状態をゆっくり成長するサブタイプ細胞のものに変換できるマスター調節因子としてCCDC85Bを同定した。さらに,in vitro実験によりこれを検証し,幹細胞性及び非制御細胞増殖を抑制することにより悪性CRC発生を予防する可能性のある新規潜在的治療標的としてのCCDC85Bを示唆した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  細胞増殖 ,  個体群 ,  成長速度 ,  in vitro実験 ,  遺伝子変異
準シソーラス用語： *システム生物学 ,  トランスクリプトーム解析 ,  調節因子 ,  単一細胞 ,  結腸直腸癌 ,  治療標的 ,  予後予測マーカー ,  幹細胞性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 結腸直腸癌 ,  大腸腺腫症 ,  単一細胞トランスクリプトミクス ,  遺伝子調節ネットワーク ,  CCDC85B ,  システム生物学 ,  マスターレギュレータ解析

分類 (4件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (48件)：

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• AlvarezM. J.ShenY.GiorgiF. M.LachmannA.DingB. B.YeB. H.. (2016). Functional characterization of somatic mutations in cancer using network-based inference of protein activity. Nat. Genet. 48, 838-847. doi: doi: 10.1038/ng.3593, PMID: 27322546
• AshburnerM.BallC. A.BlakeJ. A.BotsteinD.ButlerH.CherryJ. M.. (2000). Gene Ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat. Genet. 25, 25-29. doi: doi: 10.1038/75556, PMID: 29608179
• ButlerA.HoffmanP.SmibertP.PapalexiE.SatijaR. (2018). Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species. Nat. Biotechnol. 36, 411-420. doi: doi: 10.1038/nbt.4096
• CalifanoA.AlvarezM. J. (2017). The recurrent architecture of tumour initiation, progression and drug sensitivity. Nat. Rev. Cancer 17, 116-130. doi: doi: 10.1038/nrc.2016.124, PMID: 27977008

タイトルに関連する用語 (8件)： 早期大腸癌 ,  モデル ,  増殖 ,  細胞 ,  マスター ,  レギュレータ ,  同定 ,  システム生物学