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J-GLOBAL ID：202002214141829130   整理番号：20A1116091

単一転写因子誘導により摂動された細胞状態の系統的分析のための2,135ヒトESCラインの生成とプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Generation and Profiling of 2,135 Human ESC Lines for the Systematic Analyses of Cell States Perturbed by Inducing Single Transcription Factors

著者 (27件)： Nakatake Yuhki (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Ko Shigeru B.H. (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Sharov Alexei A. (Laboratory of Genetics and Genomics, National Institute on Aging, National Institutes of Health, Baltimore, MD 21224-6825, USA) ,  Wakabayashi Shunichi (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Murakami Miyako (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Sakota Miki (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Chikazawa Nana (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Ookura Chiaki (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Sato Saeko (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Ito Noriko (DNA Chip Research, Tokyo 105-0022, Japan) ,  Ishikawa-Hirayama Madoka (DNA Chip Research, Tokyo 105-0022, Japan) ,  Mak Siu Shan (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Jakt Lars Martin (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Ueno Tomoo (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Hiratsuka Ken (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Matsushita Misako (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Goparaju Sravan Kumar (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Akiyama Tomohiko (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Ishiguro Kei-ichiro (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Oda Mayumi (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Gouda Norio (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan) ,  Umezawa Akihiro (Department of Reproductive Biology, National Research Institute for Child Health and Development, Tokyo 157-8535, Japan) ,  Akutsu Hidenori (Department of Reproductive Biology, National Research Institute for Child Health and Development, Tokyo 157-8535, Japan) ,  Nishimura Kunihiro (Xcoo, Tokyo 113-0033, Japan) ,  Matoba Ryo (DNA Chip Research, Tokyo 105-0022, Japan) ,  Ohara Osamu (Kazusa DNA Research Institute, Chiba 292-0818, Japan) ,  Ko Minoru S.H. (Department of Systems Medicine, Keio University School of Medicine, Tokyo 160-8582, Japan)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 31  号： 7  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写因子(TF)は細胞状態の決定に重要な役割を果たすが,TFと細胞状態の間の因果関係の理解は限られている。ここでは,単一TFの大規模操作によりヒト多能性胚幹細胞(hESC)の状態変化を系統的に検討した。481個のTFを含む714個のドキシサイクリン(Dox)誘導性遺伝子の各々3個のクローンを表す2135個のhESC系統を確立し,Doxの存在または不在後に26,998個の顕微鏡細胞画像と2,174個のトランスクリプトームの遺伝子配列(RNA-seq)またはマイクロアレイ-48時間を得た。興味あることに,ヘテロクロマチン領域に位置する遺伝子を含む全ての遺伝子の発現はこれらのTFにより撹乱される。また,TFはhESCの特異的な細胞系統への分化を誘導する能力によって特性化される。これらの分析は,TFsを分類する方法を提供し,望ましい細胞型へのhESC分化を指示するためのTFの特異的セットを同定するのに役立つ。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  ヒト ,  分化 ,  汎用性 ,  クローン ,  ヘテロクロマチン ,  細胞分化 ,  *転写因子 ,  ES細胞 ,  トランスクリプトーム ,  細胞株 ,  遺伝子配列 ,  細胞型 ,  マイクロアレイ ,  発生生理
準シソーラス用語： プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヒト胚幹細胞 ,  転写因子 ,  条件付き誘導 ,  トランスクリプトーム ,  細胞分化

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発生と分化  (EJ16020W)

タイトルに関連する用語 (9件)： 転写因子 ,  誘導 ,  摂動 ,  細胞 ,  系統 ,  分析 ,  ヒト ,  ESC ,  プロファイリング