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J-GLOBAL ID：202002216108972250   整理番号：20A2342056

ミカン類におけるPhyllosticta citricarpa,Elsinoee fawcettii,Elsinoee australis,およびPseudocercospora angolensisの1管検出のための新規多重従来型PCRおよび四重鎖リアルタイムPCRアッセイ:開発および検証【JST・京大機械翻訳】

New multiplex conventional PCR and quadruplex real-time PCR assays for one-tube detection of Phyllosticta citricarpa, Elsinoee fawcettii, Elsinoee australis, and Pseudocercospora angolensis in Citrus: development and validation

著者 (8件)： Ahmed Yosra (Plant Quarantine Pathogens Laboratory (PQPL), Plant Pathology Research Institute, Agricultural Research Center, Giza, Egypt) ,  Ahmed Yosra (ANSES Laboratoire de la Sante des Vegetaux, Unite de Mycologie, Malzeville, France) ,  Hussein Ahmed (Central Administration of Plant Quarantine, Ministry of Agriculture and Land Reclamation, Dokki, Giza, Egypt) ,  Hussein Ahmed (Regional Office for Near East and North Africa, Food and Agriculture Organization of the United Nations, Dokki, Giza, Egypt) ,  Hubert Jacqueline (ANSES Laboratoire de la Sante des Vegetaux, Unite de Mycologie, Malzeville, France) ,  Fourrier-Jeandel Celine (ANSES Laboratoire de la Sante des Vegetaux, Unite de Mycologie, Malzeville, France) ,  Aguayo Jaime (ANSES Laboratoire de la Sante des Vegetaux, Unite de Mycologie, Malzeville, France) ,  Ioos Renaud (ANSES Laboratoire de la Sante des Vegetaux, Unite de Mycologie, Malzeville, France)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 104  号： 21  ページ： 9363-9385  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Phyllosticta citrcarpa,Elsinoee fawettii,Elsinoee australis,およびPseudocercospora angolensisは,世界中の柑橘類作物の主要な病原体であり,原因物質に関する混乱につながる可能性がある非特性症状を引き起こす。これらの菌類は国際植物衛生規制を受け,果実または葉に関する試験は正確で使いやすいツールを必要とする。果実組織における4つの真菌病原体の高精度同時検出を達成するために,新しいマルチプレックスPCRとリアルタイムPCRアッセイを開発した。P.citricarpa,E.fawettiiおよびE.australisに対する新規オリゴヌクレオチド組合せを設計し,それらを既に利用可能なプライマーおよび加水分解プローブと組み合わせてPCRアッセイに用いた。マルチプレックスの従来のPCRの検出限界は,P.citricarpa,E.fawettii,及びE.australisに対して100pgμL-1,及びP.angolensisに対して反応管当たり10pgμL-1の標的DNAであった。四重螺旋リアルタイムPCRアッセイは,それぞれ,P.citricarpa,E.fawettii,E.australisおよびP.angolensisの標的DNAの242,243,241および242のプラスミドコピーと同程度の反復陽性結果をもたらした。さらに,60の天然感染柑橘類試料の分析は,両アッセイで100%の一致結果をもたらした。著者らの検証実験は,多重リアルタイムPCRアッセイがP.paracitricarpa DNAとの交差反応を除いて高い特異性を示したことを明らかにした。感度,再現性,およびロバスト性を検証し,アッセイを種々のDNA抽出手順に従って使用することができ,ルーチン分析の適応性を支持した。これらの新しいマルチプレックスツールは,規制当局と診断研究所の費用対効果の高い解決策として大きな興味があり,単一管反応における4つの重要な病原体の試験を可能にする。キーポイント:4つの柑橘類病原体に対する新しい従来のPCRとqPCRアッセイの開発が,マルチプレックスの従来のPCR法に対して,高い特異性,感度,繰り返し性,再現性,およびロバスト性を有する。Copyright Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  加水分解 ,  DNA【核酸】 ,  オリゴヌクレオチド ,  *多重化 ,  真菌類 ,  プラスミド ,  病原体 ,  検出限界 ,  ロバスト性 ,  四重螺旋 ,  *リアルタイムPCR法 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： DNA抽出 ,  同時検出 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： カンキツ黒斑 ,  ミカン類 ,  Pseudocercosporaの葉と果実スポット ,  Citrus quarantine病原体

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (9件)： ミカン類 ,  Phyllosticta ,  多重 ,  PCR ,  重鎖 ,  リアルタイムPCR ,  アッセイ ,  開発 ,  検証