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J-GLOBAL ID：202002216245105062   整理番号：20A0502753

バイオ情報解析に基づく結腸直腸癌におけるハブ遺伝子と重要な経路同定【JST・京大機械翻訳】

Hub Genes and Key Pathway Identification in Colorectal Cancer Based on Bioinformatic Analysis

著者 (2件)： Lv Jian ( Central Laboratory, Renmin Hospital of Wuhan University, Wuhan 430060, China) ,  Li Lili ( Central Laboratory, Renmin Hospital of Wuhan University, Wuhan 430060, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2019  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は最も一般的悪性腫瘍の1つである。本研究の目的は,CRCの機構の理解を改善するための重要な遺伝子と経路を同定することであった。203のCRCサンプルと160の対照サンプルを含むGSE87211を,差別的に発現した遺伝子(DEG)を同定するためにスクリーニングした。全部で853のDEGが得られ,363の上方制御された遺伝子と490の下方制御された遺伝子を含んでいた。濃縮データセットを得るために,Genesの遺伝子オントロジー(GO)とGenes and Genomes(KEGG)分析を行った。GO分析は,DEGが細胞外領域,細胞-細胞シグナリング,ホルモン活性,およびサイトカイン活性において有意に濃縮されていることを示した。KEGG経路分析は,DEGが主にサイトカイン-サイトカイン受容体相互作用,薬物代謝,アンドロゲンおよびエストロゲン代謝,および神経活性リガンド-受容体相互作用に富むことを明らかにした。DEGの蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを,相互作用遺伝子(STRING)の検索ツールを用いて構築した。Cytosscapeにおけるpapp MCODEプラグを用いて,疾患発生に関与する重要なモジュールを調査した。上部2つのモジュールに関与する43の重要な遺伝子を同定した。6つのハブ遺伝子(CXCL_2,CXCL_3,PTGDR2,GRP,CXCL_11,およびAGTR1)は,患者全体の生存または無病生存と統計学的に関連していた。6つのハブ遺伝子の機能は,主にホルモンとケモカイン活性に関連した。結論として,本研究はCRC発生の分子機構の理解を助ける可能性がある。Copyright 2019 Jian Lv and Lili Li. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： サイトカイン受容体 ,  ネットワーク ,  薬物代謝 ,  ダウンレギュレーション ,  サイトカイン ,  ホルモン ,  アップレギュレーション ,  受容体 ,  プラグ ,  男性ホルモン ,  ケモカイン ,  *遺伝子 ,  相互作用
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (31件)：

• W. Chen, R. Zheng, P. D. Baade et al., "Cancer statistics in China, 2015," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 66, no. 2, pp. 115-132, 2016.
• P. W. Voorneveld, M. S. Reimers, E. Bastiaannet et al., "Statin use after diagnosis of colon cancer and patient survival," Gastroenterology, vol. 153, no. 2, pp. 470.e4-479.e4, 2017.
• K. Ganesh, Z. K. Stadler, A. Cercek et al., "Immunotherapy in colorectal cancer: rationale, challenges and potential," Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, vol. 16, no. 6, pp. 361-375, 2019.
• W. S. Atkin, R. Edwards, I. Kralj-Hans et al., "Once-only flexible sigmoidoscopy screening in prevention of colorectal cancer: a multicentre randomised controlled trial," The Lancet, vol. 375, no. 9726, pp. 1624-1633, 2010.
• C. M. Rutter, E. Johnson, D. L. Miglioretti, M. T. Mandelson, J. Inadomi, D. S. M. Buist, "Adverse events after screening and follow-up colonoscopy," Cancer Causes & Control, vol. 23, no. 2, pp. 289-296, 2012.

タイトルに関連する用語 (6件)： 情報解析 ,  結腸直腸癌 ,  ハブ ,  遺伝子 ,  経路 ,  同定