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J-GLOBAL ID：202002217118363335   整理番号：20A2646554

Trpケージミニ蛋白質の尿素誘導アンフォールディングに対するコリン-O-硫酸塩の浸透効果のin silico研究:レプリカ交換分子動力学シミュレーションからの原子論的見解【JST・京大機械翻訳】

In silico study of osmolytic effects of choline-O-sulfate on urea induced unfolding of Trp-cage mini-protein: An atomistic view from replica exchange molecular dynamics simulation

著者 (2件)： Paul Srijita (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology, Guwahati, Assam, 781039, India) ,  Paul Sandip (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology, Guwahati, Assam, 781039, India)
資料名： Archives of Biochemistry and Biophysics  (Archives of Biochemistry and Biophysics)
巻： 695  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0023A  ISSN： 0003-9861  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質折畳みの事象は必須の生物学的機能と関連し,蛋白質天然状態の変性は細胞内毒性を引き起こし,生物学的機能障害及び細胞死さえも誘導する。本研究では,Replica交換分子動力学(REMD),広範な自由エネルギー計算および温度走査自由エネルギー景観を用いて,変性および保護オスモライト尿素およびコリン-O-硫酸塩(COS)の存在下で,小球状蛋白質Trp-ケージの折畳み-非折畳み平衡を検討した。6M尿素は蛋白質を容易に変性するが,0.5Mおよび1M COSは,室温で尿素誘導変性から蛋白質を保護できることを示した。しかしながら,REMDシミュレーションは,純水中の蛋白質が,融解なしで420Kの高いシミュレーション温度に耐えることができる一方,0.5Mおよび1M COSの保護効果は,それぞれ300および340Kまで操作されることを明らかにした。本研究は,尿素誘導蛋白質アンフォールディングに関するCOSの防御機構に光を当てる証拠を提供し,それによって,異なる型の蛋白質に対する適切な保護オスモライトとしてCOSの使用を提唱した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  *シミュレーション ,  *浸透 ,  *硫酸塩 ,  *タンパク質 ,  *デコンボリューション ,  折畳み ,  生物活性 ,  *分子動力学 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： 蛋白質折畳み ,  *in silico ,  浸透圧調節物質 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *レプリカ交換 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Trpケージミニ蛋白質 ,  尿素 ,  変性 ,  オスモライト ,  コリン-O-硫酸塩 ,  REMD

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： 尿素

タイトルに関連する用語 (13件)： TRP ,  ケージ ,  蛋白質 ,  尿素 ,  誘導 ,  アンフォールディング ,  コリン ,  硫酸塩 ,  浸透 ,  研究 ,  レプリカ交換 ,  分子動力学シミュレーション ,  見解