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J-GLOBAL ID：202002218414894370   整理番号：20A1939248

Helicobacter pyloriにおけるネットワーク化と特異性変化DNAメチルトランスフェラーゼ【JST・京大機械翻訳】

Networking and Specificity-Changing DNA Methyltransferases in Helicobacter pylori

著者 (22件)： Yano Hirokazu (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Yano Hirokazu (Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Alam Md. Zobaidul (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Rimbara Emiko (Department of Bacteriology II, National Institute of Infectious Diseases (NIID), Musashimurayama, Japan) ,  Shibata Tomoko F. (National Institute for Basic Biology (NIBB), Okazaki, Japan) ,  Fukuyo Masaki (School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Furuta Yoshikazu (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Furuta Yoshikazu (Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Nishiyama Tomoaki (Advanced Science Research Center, Kanazawa University, Kanazawa, Japan) ,  Shigenobu Shuji (National Institute for Basic Biology (NIBB), Okazaki, Japan) ,  Hasebe Mitsuyasu (National Institute for Basic Biology (NIBB), Okazaki, Japan) ,  Hasebe Mitsuyasu (Department of Basic Biology, School of Life Sciences, SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies), Okazaki, Japan) ,  Toyoda Atsushi (Advanced Genomics Center, National Institute of Genetics, Mishima, Japan) ,  Suzuki Yutaka (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Sugano Sumio (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Sugano Sumio (Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Shibayama Keigo (Department of Bacteriology II, National Institute of Infectious Diseases (NIID), Musashimurayama, Japan) ,  Kobayashi Ichizo (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Kobayashi Ichizo (Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Kobayashi Ichizo (Department of Infectious Diseases, School of Medicine, Kyorin University, Mitaka, Japan) ,  Kobayashi Ichizo (Institut de Biologie Integrative de la Cellule (I2BC), Universite Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France) ,  Kobayashi Ichizo (Research Center for Micro-Nano Technology, Hosei University, Koganei, Japan)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 1628  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エピジェネティックDNA塩基メチル化は遺伝子発現調節において重要な役割を果たす。ここでは,しばしばその標的配列特異性を変化させる多くのDNAメチルトランスフェラーゼから成る遺伝子発現調節ネットワークについて述べる。胃癌のほとんどの発生に関与する細菌であるHelicobacter pyloriは,配列特異的DNAメチルトランスフェラーゼの大きく多様なレパートリーを有する。メチルトランスフェラーゼに対する単一遺伝子ノックアウト菌株を作出することにより,これらがメチラーゼ,トランスクリプトームおよび適応表現型セットを制御するネットワークを形成することを明らかにした。メチルトランスフェラーゼは階層的方法で互いに相互作用し,時には1つのメチルトランスフェラーゼにより正に調節されるが,もう1つとは負に調節される。運動性,酸化ストレス耐性およびDNA損傷修復は,複数のメチルトランスフェラーゼにより同様に調節される。それらの調節は翻訳開始と停止コドンを含み,メチル化,転写と翻訳の結合を示唆する。メチルトランスフェラーゼは,それらの標的認識ドメインの遺伝子変換を通してそれらの配列特異性を頻繁に変化させ,それらの標的セットをスイッチしてネットワークを再モデル化する。メタモルフィング遺伝子調節ネットワーク,または,適応のための探索においてそれらの特異性を絶えず変化させるエピジェネティックシステムから成るファイアワークの新興画像は,全体的遺伝子調節および適応進化の理解において新しいパラダイムを提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  細菌 ,  メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  表現型 ,  *メチルトランスフェラーゼ ,  *DNAメチルトランスフェラーゼ ,  DNA損傷 ,  *Helicobacter pylori ,  トランスクリプトーム ,  エピジェネティクス ,  DNAメチル化 ,  遺伝子発現調整 ,  *微生物 ,  *らせん菌 ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝的調節 ,  遺伝子発現調節 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： エピジェネティクス ,  メチローム ,  DNAメチル化 ,  胃癌 ,  エピゲノム ,  DNAメチルトランスフェラーゼ ,  SMRT ,  パクバイオ

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (68件)：

• Anders S., Pyl P. T., Huber W. (2015). HTSeq-a Python framework to work with high-throughput sequencing data. Bioinformatics 31 166-169. doi: 10.1093/bioinformatics/btu638
• Andres S., Skoglund A., Nilsson C., Krabbe M., Björkholm B., Engstrand L. (2010). Type I restriction-modification loci reveal high allelic diversity in clinical Helicobacter pylori isolates. Helicobacter 15 114-125. doi: 10.1111/j.1523-5378.2010.00745.x
• Backert S., Yamaoka Y. (2016). Helicobacter pylori Research - From Bench to Bedside. Tokyo: Springer. doi: 10.1111/j.1523-5378.2010.00745.x
• Banerjee A., Rao D. N. (2011). Functional analysis of an acid adaptive DNA adenine methyltransferase from Helicobacter pylori 26695. PLoS One 6:e16810. doi: 10.1371/journal.pone.0016810
• Bereswill S., Waidner U., Odenbreit S., Lichte F., Fassbinder F., Bode G., et al (1998). Structural, functional and mutational analysis of the pfr gene encoding a ferritin from Helicobacter pylori. Microbiology 144(Pt 9), 2505-2516. doi: 10.1099/00221287-144-9-2505

タイトルに関連する用語 (3件)： Helicobacter ,  特異性 ,  DNAメチルトランスフェラーゼ