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J-GLOBAL ID：202002236451551678   整理番号：20A0976975

サウジアラビアにおけるBLA KPC-2を保有するKlebsiella pseudopneumoniaeの最初の報告【JST・京大機械翻訳】

First report of Klebsiella quasipneumoniae harboring bla KPC-2 in Saudi Arabia

著者 (21件)： Hala Sharif (Pathogen Genomics Laboratory, Biological and Environmental Sciences and Engineering, King Abdullah University of Science and Technology, Thuwal, Saudi Arabia) ,  Hala Sharif (Clinical Microbiology Department, King Abdullah International Medical Research Centre - Ministry of National Guard Health Affairs, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Hala Sharif (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Antony Chakkiath Paul (Pathogen Genomics Laboratory, Biological and Environmental Sciences and Engineering, King Abdullah University of Science and Technology, Thuwal, Saudi Arabia) ,  Antony Chakkiath Paul (Red Sea Research Center, Biological and Environmental Sciences and Engineering, King Abdullah University of Science and Technology, Thuwal, Saudi Arabia) ,  Alshehri Mohammed (Clinical Microbiology Department, King Abdullah International Medical Research Centre - Ministry of National Guard Health Affairs, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Alshehri Mohammed (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Althaqafi Abdulhakeem O. (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Althaqafi Abdulhakeem O. (WHO Collaborating Centre for Infection Prevention and Control, and GCC Center for Infection Control, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Alsaedi Asim (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Alsaedi Asim (WHO Collaborating Centre for Infection Prevention and Control, and GCC Center for Infection Control, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Mufti Areej (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Kaaki Mai (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Alhaj-Hussein Baraa T. (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Zowawi Hosam M. (Clinical Microbiology Department, King Abdullah International Medical Research Centre - Ministry of National Guard Health Affairs, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Zowawi Hosam M. (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Zowawi Hosam M. (WHO Collaborating Centre for Infection Prevention and Control, and GCC Center for Infection Control, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Zowawi Hosam M. (UQ Centre for Clinical Research, Herston, Queensland, The University of Queensland, Queensland, Australia) ,  Al-Amri Abdulfattah (King Saud bin Abdulaziz University for Health Sciences, Jeddah, Saudi Arabia) ,  Pain Arnab (Pathogen Genomics Laboratory, Biological and Environmental Sciences and Engineering, King Abdullah University of Science and Technology, Thuwal, Saudi Arabia) ,  Pain Arnab (Global Station for Zoonosis Control, Global Institution for Collaborative Research and Education (GI-CoRE), Hokkaido University, Thuwal, Japan)
資料名： Antimicrobial Resistance & Infection Control (Web)  (Antimicrobial Resistance & Infection Control (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 1-8  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7299A  ISSN： 2047-2994  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多剤耐性腸内細菌科により引き起こされる院内感染は,迅速に同定され,報告され,正確に対処されるべき世界的な公衆衛生脅威である。多くのカルバペネム耐性腸内細菌関連遺伝子はサウジアラビアにおいて同定されているが,blaKPC型遺伝子によりコードされている固有のKlebsiella pneumoniae カルバペネム(KPCs)では同定されていない。KPCsはそれらの例外的な広がりポテンシャルに対して知られている。著者らはn=286の多剤耐性(MDR)クレブシエラ属を収集し,2014年と2018年の間のサウジアラビアの第三病院からの耐性パターンのスクリーニングの一部として分離した。抗微生物感受性試験を,VITEK IIと全収集分離株のブロス微量希釈の両方を用いて行った。耐性付与遺伝子の検出は,Illumina全ゲノムショットガン配列決定とPacBio SMRT配列決定プロトコルを用いて行った。カルバペネム耐性腸内細菌科(CRE)Klebsiella pseud.pneumoniae subsp.similis株は,blaKPC-2カルバペネムをコードする遺伝子を持つ新しいST-3510と同定された。NGKPC-421と命名された分離株は,286のMDRクレブシエラ属のショットガンWホールゲノム配列(WGS)サーベイランスから得られ,臨床分離株が得られた。NGKPC-421分離株は,2017年代後半に敗血症患者から収集され,肺炎桿菌として最初に誤認された。NGKPC-421ゲノムの配列決定と集合は,転移可能な要素(ISKpn6-blaKPC-2-ISKpn27)によって隣接するblaKPC-2遺伝子を持つ推定39.4kb IncX6プラスミドの同定をもたらした。これは湾地域におけるKPC-2生産CREの最初の同定である。この知見に対する影響は,サウジアラビアにおける公衆衛生に対する主要な関心事であり,それが世界中からのpilgriの連続的な大量流入による宗教的な震央であることを考慮している。著者らの研究は,正確な分類学的分類と抗菌抵抗性パターンのモニタリングのための臨床微生物学における迅速な隔離ベース技術の実行の重要性を強く強調する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  肺炎 ,  ゲノム ,  プラスミド ,  *Klebsiella ,  公衆衛生 ,  肺炎桿菌 ,  敗血症 ,  院内感染 ,  多剤耐性 ,  細菌感染症 ,  カルボン酸 ,  ラクタム
準シソーラス用語： 腸内細菌 ,  ゲノム配列 ,  分離株 ,  カルバペネム耐性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： MDR ,  Klebsiella 準肺炎 ,  カルバペネム ,  KPC-2 ,  blaKPC-2 ,  Tn3

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

物質索引 (1件)： カルバペネム

引用文献 (49件)：

• Drugs.; Novel Beta-lactamase inhibitors: unlocking their potential in therapy; DR Wong, D Duin; 77; 6; 2017; 615-628; 10.1007/s40265-017-0725-1; citation_id=CR1
• Clin Microbiol Rev; β-Lactamase production in key gram-negative pathogen isolates from the Arabian peninsula; HM Zowawi, HH Balkhy, TR Walsh, DL Paterson; 26; 3; 2013; 361-380; 10.1128/CMR.00096-12; citation_id=CR2
• Journal of Infection; Risk factors for mortality among carbapenem-resistant enterobacteriaceae carriers with focus on immunosuppression; Haggai Bar-Yoseph, Nadav Cohen, Alexander Korytny, Elias R. Andrawus, Razi Even Dar, Yuval Geffen, Khetam Hussein, Mical Paul; 78; 2; 2019; 101-105; 10.1016/j.jinf.2018.10.003; citation_id=CR3
• Sci Rep; Detection of high-risk carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae isolates using volatile molecular profiles; CA Rees, M Nasir, A Smolinska, AE Lewis, KR Kane, SE Kossmann; 8; 1; 2018; 13297; 10.1038/s41598-018-31543-x; citation_id=CR4
• Krapp F, Ozer EA, Qi C, Hauser AR, editors. Case Report of an Extensively Drug-Resistant Klebsiella pneumoniae Infection With Genomic Characterization of the Strain and Review of Similar Cases in the United States. Open forum infectious diseases 2018;Vol. 5, No. 5, p. ofy074. US: Oxford University Press.

タイトルに関連する用語 (4件)： サウジアラビア ,  保有 ,  Klebsiella ,  報告