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J-GLOBAL ID：202002240667569246   整理番号：20A2221898

疾患関連環状RNA:生物学からコンピュータ同定まで【JST・京大機械翻訳】

Disease-Associated Circular RNAs: From Biology to Computational Identification

著者 (4件)： Tang Min (School of Life Sciences, Jiangsu University, 301 Xuefu Road, Zhenjiang, Jiangsu 212013, China) ,  Kui Ling (Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, MA 02215, USA) ,  Lu Guanyi (Beijing Institute of Pharmacology and Toxicology, 27 Taiping Road, Beijing 100850, China) ,  Chen Wenqiang (Section on Integrative Physiology and Metabolism, Joslin Diabetes Center, Harvard Medical School, 1 Joslin Place, Boston, MA 02115, USA)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環状RNA(circRNA)は,プレmRNAの様々なバックスプライシング事象を介して発生する共有結合閉鎖連続ループを有する内因性RNAである。蓄積数の研究は,circRNAが癌やAlzheimer病のような主要なヒト疾患に対する潜在的バイオマーカーであることを示した。したがって,ヒト疾患関連循環RNAの同定と予測は非常に重要である。この目的のために,計算解析支援戦略は,下流応用に対するサーコRNAの検出,検証,定量化に不可欠である。本レビューでは,生物発生,特性,および生物学的機能を含む循環RNAの生物学を簡潔に紹介した。さらに,サーコRNA研究に対して公的に利用できる最近のバイオインフォマティクス分析ツールについて概説する。これらの計算戦略と考察を適用するための原理を簡潔に論じた。最後に,頻繁に使用される20以上の重要な計算データベースに関する完全な調査を与えた。著者らの知る限り,これは公的に利用可能な循環RNA資源に関する最も完全で最新の要約である。結論として,本レビューはサーコRNA生物学の重要な側面をまとめ,circRNAのゲノムワイド同定と予測を促進する重要な計算戦略を概説する。Copyright 2020 Min Tang et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  生物活性 ,  共有結合 ,  Alzheimer病 ,  *コンピュータ ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  内因性 ,  解析ツール ,  生物発生 ,  ヒトの病気 ,  *環状RNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 循環系の基礎医学  (GJ01020K) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (199件)：

• J. Salzman, C. Gawad, P. L. Wang, N. Lacayo, P. O. Brown, "Circular RNAs are the predominant transcript isoform from hundreds of human genes in diverse cell types," PLoS One, vol. 7, no. 2, article e30733, 2012.
• J. T. Granados-Riveron, G. Aquino-Jarquin, "The complexity of the translation ability of circRNAs," Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms, vol. 1859, no. 10, pp. 1245-1251, 2016.
• Q. Zheng, C. Bao, W. Guo, S. Li, J. Chen, B. Chen, Y. Luo, D. Lyu, Y. Li, G. Shi, L. Liang, J. Gu, X. He, S. Huang, "Circular RNA profiling reveals an abundant circHIPK3 that regulates cell growth by sponging multiple miRNAs," Nature Communications, vol. 7, no. 1, article 11215, 2016.
• Z. Li, C. Huang, C. Bao, L. Chen, M. Lin, X. Wang, G. Zhong, B. Yu, W. Hu, L. Dai, P. Zhu, Z. Chang, Q. Wu, Y. Zhao, Y. Jia, P. Xu, H. Liu, G. Shan, "Exon-intron circular RNAs regulate transcription in the nucleus," Nature Structural & Molecular Biology, vol. 22, no. 3, pp. 256-264, 2015.
• S. J. Conn, K. A. Pillman, J. Toubia, V. M. Conn, M. Salmanidis, C. A. Phillips, S. Roslan, A. W. Schreiber, P. A. Gregory, G. J. Goodall, "The RNA binding protein quaking regulates formation of circRNAs," Cell, vol. 160, no. 6, pp. 1125-1134, 2015.

タイトルに関連する用語 (5件)： 疾患 ,  環状RNA ,  生物学 ,  コンピュータ ,  同定