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J-GLOBAL ID：202002243300700328   整理番号：20A2512079

重力外寄生体Varroa破壊因子における長鎖非コードRNAのゲノムワイド同定【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification of Long Non-coding RNAs in the Gravid Ectoparasite Varroa destructor

著者 (12件)： Lin Zheguang (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Liu Yibing (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Chen Xiaomei (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Han Cong (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Wang Wei (Wuzhong Animal Health Supervision Institute, Suzhou, China) ,  Ke Yalu (Wuzhong Animal Health Supervision Institute, Suzhou, China) ,  Su Xiaoling (Jinhua Academy of Agricultural Sciences, Jinhua, China) ,  Li Yujiao (Shandong Apiculture Breeding of Improved Varieties and Extension Center, Tai’an, China) ,  Chen Heng (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Xu Hao (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Chen Guohong (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Ji Ting (Apicultural Research Institute, College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 575680  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長い非コードRNA(lncRNAs)は,生きている生物における多様な生物学的機能を通して重要な調節因子として出現する。しかし,今日まで,lncRNAsの系統的特性化は,世界中でミツバチのミツバチに対する最も厳しい生物的脅威であるエクト寄生虫ダニVarroaデトラクタにおいて調べられていない。ここでは,ハイスループット配列決定技術によりV.destructorにおけるlncRNAの初期ゲノムワイド同定を行い,初めて,破壊寄生虫におけるlncRNAのトランスクリプトミクス景観を初めて報告した。lncRNA同定パイプラインにより,3,897遺伝子座によりコードされた6,645の新規lncRNA転写物を同定し,2,066センスlncRNA,2772lincRNA,および1,807lncNATを含む。蛋白質コードmRNAと比較して,V.destructor lncRNAは全長に関して短く,またORF長はより少ないエキソンを含み,低レベルで発現していた。lncRNA標的遺伝子のGO項とKEGG経路濃縮分析は,これらの予測lncRNAがV.destructorの生殖相における細胞及び生物学的進展の調節機能に潜在的に関与する可能性を示した。我々の知る限りでは,これは寄生バチ種におけるlncRNAプロファイルの最初のカタログであり,遺伝的およびゲノム研究の貴重な資源を提供する。V.destructorにおけるlncRNAの特性および特徴を理解することは,持続可能な寄生虫制御を促進するであろう。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *重力 ,  mRNA ,  遺伝 ,  寄生虫 ,  生殖 ,  タンパク質 ,  ミツバチ ,  生物活性 ,  寄生バチ
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  トランスクリプトーム解析 ,  調節因子 ,  ハイスループット ,  標的遺伝子 ,  KEGG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Varroa destructor ,  長鎖非コードRNA ,  ミツバチ ,  外寄生ダニ ,  卵形成

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (63件)：

• CaoZ.PanX.YangY.HuangY.ShenH.-B. (2018). The lncLocator: a subcellular localization predictor for long non-coding RNAs based on a stacked ensemble classifier. Bioinformatics 34 2185-2194. doi: 10.1093/bioinformatics/bty085 29462250
• CesanaM.CacchiarelliD.LegniniI.SantiniT.SthandierO.ChinappiM. (2011). A long noncoding RNA controls muscle differentiation by functioning as a competing endogenous RNA. Cell 147 358-369. doi: 10.1016/j.cell.2011.09.028 22000014
• ChenD.ChenH.DuY.ZhouD.GengS.WangH. (2019). Genome-wide identification of long non-coding RNAs and their regulatory networks lnvolved in Apis mellifera ligustica response to Nosema ceranae infection. Insects 10:245. doi: 10.3390/INSECTS10080245 31405016
• ChenL.-L. (2016). Linking long noncoding RNA localization and function. Trends Biochem. Sci. 41 761-772. doi: 10.1016/j.tibs.2016.07.003 27499234
• ChenL.-L.CarmichaelG. G. (2010). Decoding the function of nuclear long non-coding RNAs. Curr. Opin. Cell Biol. 22 357-364. doi: 10.1016/j.ceb.2010.03.003 20356723

タイトルに関連する用語 (8件)： 重力 ,  外寄生体 ,  Varroa ,  破壊 ,  因子 ,  長鎖非コードRNA ,  ゲノム ,  同定