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J-GLOBAL ID：202002247612815334   整理番号：20A1896963

比較ゲノミクスは海洋CyanobacteriumHyella patelloidesの一意性と生合成能力を開示する【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomics Discloses the Uniqueness and the Biosynthetic Potential of the Marine Cyanobacterium Hyella patelloides

著者 (17件)： Brito Angela (i3S - Instituto de Investigacao e Inovacao em Saude, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Brito Angela (IBMC - Instituto de Biologia Molecular e Celular, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Vieira Jorge (i3S - Instituto de Investigacao e Inovacao em Saude, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Vieira Jorge (IBMC - Instituto de Biologia Molecular e Celular, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Vieira Cristina P. (i3S - Instituto de Investigacao e Inovacao em Saude, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Vieira Cristina P. (IBMC - Instituto de Biologia Molecular e Celular, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Zhu Tao (Key Laboratory of Biofuels, Shandong Provincial Key Laboratory of Synthetic Biology, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, China) ,  Leao Pedro N. (Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR/CIMAR), University of Porto, Matosinhos, Portugal) ,  Ramos Vitor (Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR/CIMAR), University of Porto, Matosinhos, Portugal) ,  Lu Xuefeng (Key Laboratory of Biofuels, Shandong Provincial Key Laboratory of Synthetic Biology, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao, China) ,  Lu Xuefeng (Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Vasconcelos Vitor M. (Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR/CIMAR), University of Porto, Matosinhos, Portugal) ,  Vasconcelos Vitor M. (Departamento de Biologia, Faculdade de Ciencias, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Gugger Muriel (Institut Pasteur, Collection des Cyanobacteries, Paris, France) ,  Tamagnini Paula (i3S - Instituto de Investigacao e Inovacao em Saude, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Tamagnini Paula (IBMC - Instituto de Biologia Molecular e Celular, Universidade do Porto, Porto, Portugal) ,  Tamagnini Paula (Departamento de Biologia, Faculdade de Ciencias, Universidade do Porto, Porto, Portugal)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 1527  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Baeocytocus シアノバクテリア(Pleurocapsless/Subection II)は地球上の広範囲の生息場所で繁殖できるが,他のシアノバクテリア系統と比較して,それらはゲノムレベルであまり研究されていない。本研究では,ポルトガルの陸上から分離した最近記述された種,Hyella属-H.patelloides LEGE 07179のメンバーから最初のゲノムを配列決定した。このゲノムはこれまでに配列決定された13のバエオサイト形成シアノバクテリアゲノムの最大であり,最も近縁の菌株から分岐する。比較分析は,H.patelloidesとその最も近い近縁種の間の菌株特異的遺伝子と水平遺伝子導入事象を明らかにした。さらに,H.patelloidesゲノムは,天然物生合成遺伝子クラスター(BGC)の数と多様性によって特徴的である。これらのクラスターの大部分は,新規天然物を合成する高い確率を有する菌株特異的BGCである。1つのBGCは末端オレフィンの生産に推定的に関与すると同定された。その結果,H.patelloidesはC_15鎖長の炭化水素を生成し,C_14,C_16及びC_18脂肪酸を乾燥細胞重量の4%以上で合成した。全体として,著者らのデータは,バエオサイトスシアノバクテリアに関する情報の増加に寄与し,H.patelloidesの進化,系統発生および天然物生合成能力に光を当てた。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *生合成 ,  炭化水素 ,  遺伝子 ,  藍藻類 ,  *海洋 ,  系統発生 ,  ゲノム ,  クラスタ ,  天然材料 ,  生息場所 ,  陸地
準シソーラス用語： 遺伝子水平移動 ,  遺伝子クラスタ ,  近縁種 ,  *比較ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 生合成遺伝子クラスター ,  シアノバクテリア ,  ゲノム ,  Hyella ,  天然製品

分類 (3件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (48件)：

• Alanjary M., Kronmiller B., Adamek M., Blin K., Weber T., Huson D., et al (2017). The Antibiotic Resistant Target Seeker (ARTS), an exploration engine for antibiotic cluster prioritization and novel drug target discovery. Nucleic Acids Res. 45 W42-W48.
• Al-Thukair A. A. (2011). Calculating boring rate of endolithic cyanobacteria Hyella immanis under laboratory conditions. Int. Biodeter. Biodegr. 65 664-667. doi: 10.1016/j.ibiod.2011.03.009
• Al-Thukair A. A., Golubic S. (1991). New endolithic cyanobacteria from the arabian gulf. I. Hyella immanis SP. NOV. 1. J. Phycol. 27 766-780. doi: 10.1111/j.0022-3646.1991.00766.x
• Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A. A., Dvorkin M., Kulikov A. S., et al (2012). SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19 455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021
• Benzerara K., Skouri-Panet F., Li J., Férard C., Gugger M., Laurent T., et al (2014). Intracellular Ca-carbonate biomineralization is widespread in cyanobacteria. P. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111 10933-10938. doi: 10.1073/pnas.1403510111

タイトルに関連する用語 (5件)： 比較ゲノミクス ,  海洋 ,  一意性 ,  生合成 ,  能力