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J-GLOBAL ID：202002248601829232   整理番号：20A1259064

統合的計算アプローチによるシグナル依存性遺伝子発現の転写調節機構の推論【JST・京大機械翻訳】

Inferring the transcriptional regulatory mechanism of signal-dependent gene expression via an integrative computational approach

著者 (8件)： Chiang Sufeng (Genome and Systems Biology Degree Program, National Taiwan University and Academia Sinica, Taipei, Taiwan) ,  Chiang Sufeng (Institute of Information Science, Academia Sinica, Taipei, Taiwan) ,  Shinohara Hisaaki (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Huang Jia-Hsin (Institute of Information Science, Academia Sinica, Taipei, Taiwan) ,  Tsai Huai-Kuang (Genome and Systems Biology Degree Program, National Taiwan University and Academia Sinica, Taipei, Taiwan) ,  Tsai Huai-Kuang (Institute of Information Science, Academia Sinica, Taipei, Taiwan) ,  Okada Mariko (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Okada Mariko (Laboratory of Cell Systems, Institute for Protein Research, Osaka University, Suita, Japan)
資料名： FEBS Letters  (FEBS Letters)
巻： 594  号： 10  ページ： 1477-1496  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0575A  ISSN： 0014-5793  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 真核生物転写因子(TF)は,それらの標的遺伝子の発現を調節するために異なる上流シグナルを調整する。B細胞受容体シグナル伝達におけるこの調節ネットワークを明らかにするために,細胞外シグナル調節キナーゼ(ERK)及びIκBキナーゼ(IKK)依存性トランスクリプトーム応答を系統的に解析するための計算パイプラインを開発した。双線形回帰法と速度論モデリングを組み合わせて,それぞれ,信号対TFとTFから遺伝子の動力学を同定した。B細胞に対する一連の時間経過実験データを入力し,転写活性化因子に集中した。結果は,ERKとIKKによって差別的に制御されたTFの組合せが,B細胞応答を調整する際に発散的な発現動力学に寄与することができることを示している。著者らの知見は真核細胞におけるシグナル依存性遺伝子発現の基礎となる調節機構への洞察を提供する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  真核細胞 ,  真核生物 ,  *遺伝子発現 ,  細胞情報伝達 ,  転写因子 ,  ERK【酵素】 ,  B細胞抗原受容体 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 線形回帰 ,  転写活性化因子 ,  *転写調節 ,  *転写調節機構 ,  標的遺伝子 ,  遺伝子調節ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 組合せ制御 ,  動力学モデリング ,  回帰分析 ,  シグナル伝達 ,  転写調節 ,  転写因子

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 統合 ,  計算 ,  シグナル ,  依存性 ,  遺伝子発現 ,  転写調節 ,  推論