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J-GLOBAL ID：202002259307604958   整理番号：20A1014988

競合的内因性RNAに基づくCircRNA-miRNA-mRNAネットワークの構築は骨肉腫におけるCircRNAの機能を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Construction of a circRNA-miRNA-mRNA network based on competitive endogenous RNA reveals the function of circRNAs in osteosarcoma

著者 (4件)： Qiu Yu (Department of Orthopaedics, First People’s Hospital of Yibin, Yibin, China) ,  Pu Chao (Second Clinical Medical College of North Sichuan Medical College, Nanchong Central Hospital, Nanchong, China) ,  Li Yanchao (Department of Orthopaedics, First People’s Hospital of Yibin, Yibin, China) ,  Qi Baochuang (Department of Orthopaedics, First People’s Hospital of Yibin, Yibin, China)
資料名： Cancer Cell International (Web)  (Cancer Cell International (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7315A  ISSN： 1475-2867  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫(OS)は,一般的な原発性悪性骨腫瘍である。増殖証拠は,円形RNA(circRNA)が腫瘍の発生に密接に関連することを示唆する。しかしながら,OSにおけるcircRNAの機能は不明のままである。ここでは,OSにおけるcircRNAの調節機構を決定することを目的とした。OS circRNA(GSE96964),マイクロRNA(GSE65071)およびmRNA(GSE33382)の発現プロファイルは,遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースからダウンロードされ,OSにおいて差別的に発現されたcircRNA,miRNAおよびmRNAを同定した。cRNA-miRNA対とmiRNA-mRNA対に基づいて,ceRNAネットワークを構築した。有意な予後差を有するmRNAは,ネットワークにおけるTARGETデータベースにより同定された。機能的および経路濃縮分析を行い,蛋白質間の相互作用をCytosscapeを用いて予測した。遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)分析の京都エンシクロペジアを,これらの差次的に発現したcircRNAの可能な機能を明らかにするために実施した。全部で15のダウンレギュレーションされたcircRNA,136の上方制御されたmiRNAおよび52の下方制御されたmRNAがOSにおいて同定された。最後に,circRNA-miRNA-mRNAネットワークを,14のcircRNA,24のmiRNA,および52のmRNAに基づいてOSにおいて構築した。GOとKEGG経路分析は,ネットワークにおけるmRNAがOSの病因と進行に関与する可能性があることを示唆した。TARGETデータベースによって同定された4つのmRNAは,OS生存予後と有意に関連していた。これらの4つのmRNAに基づいて,circRNA-miRNA-mRNAサブネットワークを構築した。著者らの結果は,サーcRNAがOSにおける内因性RNAに競合する調節機構のより深い理解を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  予後 ,  遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  病因 ,  *マイクロRNA ,  *cRNA ,  環状RNA ,  分子遺伝現象

著者キーワード (5件)： 骨肉腫 ,  CircRNA ,  GEO ,  ターゲット ,  ネットワーク

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (44件)：

• Ann Oncol.; Osteosarcoma; J Ritter, SS Bielack; 21; Suppl 7; 2010; vii320-vii325; 10.1093/annonc/mdq276; citation_id=CR1
• Clin Adv Hematol Oncol.; Osteosarcoma: a review of diagnosis, management, and treatment strategies; DS Geller, R Gorlick; 8; 10; 2010; 705-718; citation_id=CR2
• Biochem Biophys Res Commun; FOXP4-AS1 participates in the development and progression of osteosarcoma by downregulating LATS1 via binding to LSD1 and EZH2; L Yang, D Ge, X Chen, J Qiu, Z Yin, S Zheng; 502; 4; 2018; 493-500; 10.1016/j.bbrc.2018.05.198; citation_id=CR3
• N Engl J Med.; The effect of adjuvant chemotherapy on relapse-free survival in patients with osteosarcoma of the extremity; MP Link, AM Goorin, AW Miser, AA Green, CB Pratt, JB Belasco; 314; 25; 1986; 1600-1606; 10.1056/NEJM198606193142502; citation_id=CR4
• N Engl J Med.; Adjuvant methotrexate and citrovorum-factor treatment of osteogenic sarcoma; N Jaffe, E Frei, D Traggis, Y Bishop; 291; 19; 1974; 994-997; 10.1056/NEJM197411072911902; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： 競合的内因性RNA ,  circRNA ,  miRNA ,  mRNA ,  構築 ,  骨肉腫