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J-GLOBAL ID：202002259409850856   整理番号：20A2572857

ヒト結腸のin vitroモデルにおける腸内微生物構造と機能保存のための糞便試料貯蔵のための比較法【JST・京大機械翻訳】

Comparative methods for fecal sample storage to preserve gut microbial structure and function in an in vitro model of the human colon

著者 (14件)： Deschamps Charlotte (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Fournier Elora (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Uriot Ophelie (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Lajoie Frederique (Departement de Pharmacologie et Physiologie, Faculte de Medecine, Universite de Montreal, Montreal, QC, Canada) ,  Verdier Cecile (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Comtet-Marre Sophie (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Thomas Muriel (Micalis Institute, INRAe, AgroParisTech, Universite Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France) ,  Kapel Nathalie (Laboratoire de Coprologie Fonctionnelle, Hopital Pitie-Salpetriere, Paris, France) ,  Kapel Nathalie (INSERM UMR-S1139, Universite de Paris, Paris, France) ,  Cherbuy Claire (Micalis Institute, INRAe, AgroParisTech, Universite Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France) ,  Alric Monique (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Almeida Mathieu (MetaGenoPolis, INRAe, Universite Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France) ,  Etienne-Mesmin Lucie (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) ,  Blanquet-Diot Stephanie (Universite Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 104  号： 23  ページ： 10233-10247  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 粘膜人工結腸(M-ARCOL)のようなin vitro腸モデルは,健康と疾患におけるヒトミクロビオームの役割をよりよく理解するための機構的研究を可能にするin vivoアッセイのタイムリーでコスト効率の良い代替法を提供する。ヒト糞便試料を接種したこのようなモデルの使用は,糞便貯蔵の重要な段階を必要とする。in vitro腸モデルにおける微生物構造と機能に対する保存法の影響は,あまり研究されていない。本研究は,M-ARCOLモデルにおける内腔および粘液関連微生物叢コロニー形成の動力学に及ぼす対照として用いた新鮮糞便試料と比較して,3つの一般的に使用される保存法の影響を評価することを目的とした。2つの健康なドナーからの糞便を,4つの平行バイオリアクタ(例えば,新鮮な便,-80°Cで貯蔵された生便,グリセロールと凍結乾燥された便で貯蔵された糞便)の接種の前に,凍結防止剤(10%のグリセロール)の有無で,-80°Cで48時間凍結した。Microbiota組成と多様性(qPCRと16Sメタバーコーディング)ならびに代謝活性(gaseと短鎖脂肪酸)を発酵プロセス(9日)を通してモニターした。すべての保存料処理は,複合および機能的微生物叢のM-ARCOL内部を維持することができたが,微生物プロファイルおよび活性(冷凍材料の供給に関連する技術的制約ではなく)の安定化時間を考慮して,著者らの結果は,最も効率的な方法として凍結防止剤なしで-80°Cで48時間の凍結を浮き彫りにした。これらの結果は,科学者がin vitro腸ミクロビオームモデルの接種前に糞便貯蔵のための最も正確な方法を決定するのに役立つであろう。キーポイント:in vitro ARCOLモデルは,内腔および粘膜ヒトミクロビオームを再現し,糞便試料の短期貯蔵は,微生物安定化および-80°Cでの48時間凍結,すなわち,微生物生態系を保存する最も効率的な方法,すなわち,保存方法の影響因子,および技術的要求を保存する最も効率的な方法である。Copyright Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドナー ,  *微生物 ,  凍結防止剤 ,  *結腸 ,  凍結 ,  粘膜 ,  ヒト ,  *腸内微生物 ,  ミクロフローラ ,  粘液 ,  *in vitro実験 ,  定量的PCR法 ,  脂肪族アルコール ,  ポリオール
準シソーラス用語： コロニー形成 ,  代謝活性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ヒト腸内微生物相 ,  糞便試料 ,  保存法 ,  in vitro M-ARCOLモデル

分類 (2件)： 生化学的分析法  (EA03030G) ,  微生物検査法  (EG02020G)

物質索引 (1件)： グリセロール

タイトルに関連する用語 (9件)： ヒト ,  結腸 ,  モデル ,  腸内微生物 ,  保存 ,  糞便 ,  試料 ,  貯蔵 ,  比較法