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J-GLOBAL ID：202002259778743060   整理番号：20A0430944

マイクロRNA媒介調節と関連した3遺伝子分類器は前立腺癌再発を前立腺癌再発後に予測する【JST・京大機械翻訳】

A Three-Gene Classifier Associated With MicroRNA-Mediated Regulation Predicts Prostate Cancer Recurrence After Radical Prostatectomy

著者 (9件)： Cheng Bo (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  He Qidan (2Department of Gastrointestinal Surgery, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Cheng Yong (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Yang Haifan (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Pei Lijun (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Deng Qingfu (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Long Hao (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Zhu Likun (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China) ,  Jiang Rui (1Department of Urology, The Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 1402  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景と目的:根治的前立腺切除(RP)後,前立腺癌(PCa)患者は,PCa治療において主要な問題のままである,生化学的再発(BCR)と臨床再発を経験する可能性がある。本研究の目的は,RP後のPCa再発を予測するための包括的予後指標を提供するために,マイクロRNA(miRNA)仲介調節に関連する蛋白質コード遺伝子分類器を同定することであった。【方法】候補分類器を,2つの機械学習アルゴリズム(最小絶対収縮および選択者操作[LASSO]ベース分類器および癌ゲノム地図(TCGA)データベースからの発見コホート(n=156)に基づく決定ツリーベース分類器)を用いて構築した。予測精度に基づくLASSOベースの分類器を選択した後,内部検証コホート(n=333)と外部検証コホート(n=100)の両方を用いて,生存分析,時間依存受信者動作特性(ROC)曲線解析,単変量および多変量Cox比例ハザード回帰分析を用いて分類器を調べた。共発現遺伝子の機能的濃縮分析を行い,分類装置に含まれる遺伝子の基礎となる分子機構を調べた。【結果】FAM72B,GNE,TRIM46を含む3遺伝子分類器を構築し,4つの上流予後miRNA(hsa-miR-133a-3p,hsa-miR-222-3p,hsa-miR-1301-3p,およびhsa-miR-30c-2-3p)を同定した。分類装置は,発見コホートにおける高いおよび低いGleasonスコアを有するPCa患者を区別するために,顕著な能力(曲線下面積(AUC)=0.927)を示した。さらに,それは臨床再発と有意に関連しており(p<0.0001,ログランク統計=20.7,AUC=0.733),再発のない生存の独立予後因子として役立つ可能性があった(ハザード比:1.708,95%CI:1.180~2.472,p<0.001)。さらに,BCRフリー生存分析によるBCRの予測因子であった(p=0.0338,ログランク統計=4.51)。結論:miRNA仲介調節に関連する3遺伝子分類器は,RP後のPCa患者に対する新規予後バイオマーカーとして役立つ可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  バイオマーカー ,  回帰分析 ,  データベース ,  分類装置 ,  タンパク質 ,  ディシジョンツリー ,  *前立腺腫瘍 ,  時間依存性 ,  予後 ,  学習アルゴリズム ,  ゲノム ,  母集団 ,  血中濃度-時間曲線下面積
準シソーラス用語： *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 前立腺癌 ,  根治的前立腺切除 ,  蛋白質コード遺伝子分類器 ,  臨床再発 ,  生化学的再発 ,  マイクロRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (38件)：

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• Carrillo N., Malicdan M. C., Huizing M. (2018). GNE myopathy: etiology, diagnosis, and therapeutic challenges. Neurother apeutics. 15, 900-914. doi: doi: 10.1007/s13311-018-0671-y
• Castro E., Goh C., Leongamornlert D., Saunders E., Tymrakiewicz M., Dadaev T., et al. (2015). Effect of BRCA mutations on metastatic relapse and cause-specific survival after radical treatment for localised prostate cancer. Eur. Urol. 68, 186-193. doi: doi: 10.1016/j.eururo.2014.10.022

タイトルに関連する用語 (6件)： マイクロRNA ,  調節 ,  遺伝子 ,  分類器 ,  前立腺癌再発 ,  予測