油性酵母における油蓄積システム制御のための構造方程式モデリングの応用【JST・京大機械翻訳】

Aburatani S; Shida Y; Ogasawara W; Yamazaki H; Takaku H

文献

J-GLOBAL ID：202002272893254454 整理番号：20A0397869

油性酵母における油蓄積システム制御のための構造方程式モデリングの応用【JST・京大機械翻訳】

Application of Structural Equation Modelling for Oil Accumulation System Control in Oleaginous yeast

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資料名：
巻： 1391 号： 1 ページ： 012043 (8pp) 発行年： 2019年
JST資料番号： W5565A ISSN： 1742-6588 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

最近,著者らは生細胞における調節系を明らかにするための新しい統計的方法を開発した。この方法は,因子分析と組み合わせた構造方程式モデリングに基づいている。一般的に,構造方程式モデリングは,大規模アンケートデータのような測定データによるモデル適応性を検出するために利用される。本研究では,限られた数値データから規制ネットワークとして変数間の因果関係を推論するために,開発した反復アルゴリズムと遺伝子選択手順を改良した。著者らの改良遺伝子選択法は,8時点で系統的に測定された遺伝子発現プロファイルからの時間先行情報を要約するための相互相関に基づいている。交差相関は通常,時間遅れ適用による二つの波の間の類似性の尺度として利用され,-2から+4までの範囲の遅れの値を定義した。この改良された方法によって,著者らは油性酵母における特異的システムのための制御因子として14の遺伝子を選択した。推定されたモデルにおいて,選択された14の遺伝子の中の6つの遺伝子だけが,閉鎖された特定のシステムにおける油蓄積の量に影響を及ぼすと考えられた。著者らの方法は,生物生産およびバイオテクノロジー分野における細胞系を人工的に制御するために有用である。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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分子・遺伝情報処理 , 遺伝子発現

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