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J-GLOBAL ID：202002273977374423   整理番号：20A2373257

マウスにおける活性長散在核要素1サブファミリーのための定量的PCRアッセイの確立と加齢関連レトロ転位の解析への応用【JST・京大機械翻訳】

Establishment of Quantitative PCR Assays for Active Long Interspersed Nuclear Element-1 Subfamilies in Mice and Applications to the Analysis of Aging-Associated Retrotransposition

著者 (11件)： Kuroki Ryota (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan) ,  Murata Yui (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan) ,  Fuke Satoshi (2Lab for Molecular Dynamics of Mental Disorders, RIKEN Center for Brain Science, Wako, Japan) ,  Nakachi Yutaka (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan) ,  Nakashima Jun (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan) ,  Kujoth Gregory C. (3Department of Genetics and Medical Genetics, University of Wisconsin, Madison, WI, United States) ,  Prolla Tomas A. (3Department of Genetics and Medical Genetics, University of Wisconsin, Madison, WI, United States) ,  Bundo Miki (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan) ,  Bundo Miki (4PRESTO, Japan Science and Technology Agency, Saitama, Japan) ,  Kato Tadafumi (2Lab for Molecular Dynamics of Mental Disorders, RIKEN Center for Brain Science, Wako, Japan) ,  Iwamoto Kazuya (1Department of Molecular Brain Science, Graduate School of Medical Sciences, Kumamoto University, Kumamoto, Japan)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 519206  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： レトロトランスポゾン長散在核要素-1(LINE-1)はレトロ転位過程を通して宿主ゲノム内のコピー数を自律的に増加させることができる。LINE-1は生殖系列および神経前駆細胞において活性であり,その体細胞レトロ転位活性は神経精神疾患に対する神経発達および感受性に広い影響を与える。LINE-1のゲノムコピー数を定量化する方法は,特に脳におけるレトロ転位の役割の解明に重要である。しかし,LINE-1配列の種特異的進化のため,コピー数を定量化する方法は独立して開発されるべきである。ここでは,マウスにおける活性LINE-1サブファミリーのコピー数を測定する定量的PCR(qPCR)アッセイを開発した。アッセイを用いて,野生型マウスとPolg+/D257Aマウスのいくつかの脳領域におけるLINE-1コピー数の加齢関連変化を加速加齢のモデルとして調べた。老齢Polg+/D257Aマウスは野生型マウスよりも基底核においてGfII LINE-1型の高いレベルを示し,個々の活性LINE-1サブファミリーに焦点を当てたアッセイの重要性を強調した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 感受性 ,  体細胞 ,  老化 ,  ゲノム ,  老年 ,  大脳基底核 ,  コピー数 ,  レトロトランスポゾン ,  *定量的PCR法
準シソーラス用語： 神経発生 ,  神経前駆細胞 ,  LINE-1 ,  野生型マウス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： レトロトランスポジション ,  ミトコンドリアDNA ,  非LTR ,  大脳基底核 ,  体細胞モザイク現象 ,  POLG ,  老化

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

引用文献 (48件)：

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• BedrosianT. A.QuayleC.NovaresiN.GageF. H. (2018). Early life experience drives structural variation of neural genomes in mice. Science 359, 1395-1399. doi: doi: 10.1126/science.aah3378, PMID: 29567711
• Bulut-KarsliogluA.De La Rosa-VelázquezI. A.RamirezF.BarenboimM.Onishi-SeebacherM.ArandJ.. (2014). Suv39h-dependent H3K9me3 marks intact retrotransposons and silences LINE elements in mouse embryonic stem cells. Mol. Cell 55, 277-290. doi: doi: 10.1016/j.molcel.2014.05.029, PMID: 24981170
• BundoM.ToyoshimaM.OkadaY.AkamatsuW.UedaJ.Nemoto-MiyauchiT.. (2014). Increased l1 retrotransposition in the neuronal genome in schizophrenia. Neuron 81, 306-313. doi: doi: 10.1016/j.neuron.2013.10.053, PMID: 24389010
• CordauxR.BatzerM. A. (2009). The impact of retrotransposons on human genome evolution. Nat. Rev. Genet. 10, 691-703. doi: doi: 10.1038/nrg2640, PMID: 19763152

タイトルに関連する用語 (12件)： マウス ,  活性 ,  核 ,  要素 ,  サブ ,  ファミリー ,  定量的PCR ,  アッセイ ,  加齢 ,  転位 ,  解析 ,  応用