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J-GLOBAL ID：202002280135140046   整理番号：20A1257255

ヒトノロウイルス遺伝子型II遺伝子型3におけるカプシド(VP1)領域の分子進化【JST・京大機械翻訳】

Molecular evolution of the capsid (VP1) region in human norovirus genogroup II genotype 3

著者 (14件)： Saito Mariko (Gunma Prefectural Institute of Public Health and Environmental Sciences, 378 Kamioki-machi, Maebashi-shi, Gunma 371-0052, Japan) ,  Tsukagoshi Hiroyuki (Gunma Prefectural Institute of Public Health and Environmental Sciences, 378 Kamioki-machi, Maebashi-shi, Gunma 371-0052, Japan) ,  Ishigaki Hirotaka (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Sciences, 1-7-1 Tonyamachi, Takasaki-shi, Gunma 370-0006, Japan) ,  Aso Jumpei (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Sciences, 1-7-1 Tonyamachi, Takasaki-shi, Gunma 370-0006, Japan) ,  Aso Jumpei (Kyorin University Hospital, 6-20-2 Shinkawa, Mitaka-shi, Tokyo 181-8611, Japan) ,  Ishii Haruyuki (Kyorin University Hospital, 6-20-2 Shinkawa, Mitaka-shi, Tokyo 181-8611, Japan) ,  Okayama Kaori (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Sciences, 1-7-1 Tonyamachi, Takasaki-shi, Gunma 370-0006, Japan) ,  Ryo Akihide (Department of Microbiology, Yokohama City University School of Medicine, 3-9 Fukuura, Yokohama-shi, Kanagawa 236-0004, Japan) ,  Ishioka Taisei (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Sciences, 1-7-1 Tonyamachi, Takasaki-shi, Gunma 370-0006, Japan) ,  Kuroda Makoto (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, 1-23-1 Toyama, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8640, Japan) ,  Saruki Nobuhiro (Gunma Prefectural Institute of Public Health and Environmental Sciences, 378 Kamioki-machi, Maebashi-shi, Gunma 371-0052, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences Graduate School of Infection Control Sciences, Kitasato University, 5-9-1 Shirokane, Minato-ku, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Kimura Hirokazu (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Sciences, 1-7-1 Tonyamachi, Takasaki-shi, Gunma 370-0006, Japan) ,  Kimura Hirokazu (Department of Microbiology, Yokohama City University School of Medicine, 3-9 Fukuura, Yokohama-shi, Kanagawa 236-0004, Japan)
資料名： Heliyon  (Heliyon)
巻： 6  号： 5  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3098A  ISSN： 2405-8440  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Norovirus GII.3は,急性胃腸炎患者における一般的遺伝子型であることが示唆されている。しかしながら,主要なGII.3抗原をコードするVP1領域の遺伝的性質は不明のままである。ここでは,種々の国で検出されたGII.3 VP1領域の分子進化解析を行った。時間スケールの系統発生分析,選択的圧力分析,系統発生的距離分析,及び立体配座エピトープ分析を行った。時間スケールの系統樹は,GII.3 VP1領域の祖先がGII.6,GII,11,GII,18,およびGIIの共通祖先から分岐し,約70年前に相対的に低い発散があることを示した。GII.3 VP1領域の進化率は急速であった(4.82×10~-3置換/サイト/年)。さらに,1つの陽性部位と多くの陰性選択部位がカプシド蛋白質で観察された。これらの結果は,GII.3 VP1領域が抗原性変異により急速に進化することを示唆する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  微生物 ,  *遺伝 ,  *遺伝子型 ,  抗原 ,  ウイルス感染症 ,  系統樹 ,  系統発生 ,  *分子進化 ,  *カプシド ,  抗原変異
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *VP1蛋白質 ,  カプシド蛋白質 ,  *ヒトノロウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： バイオインフォマティクス ,  微生物 ,  ウイルス学 ,  ウイルス病 ,  ウイルス遺伝学 ,  Norovirus ,  GII.3 ,  分子進化 ,  VP1

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  疫学  (GB03000E)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒトノロウイルス ,  遺伝子型 ,  カプシド ,  VP1 ,  分子進化