文献

J-GLOBAL ID：202002285075079483   整理番号：20A1580663

非定型腸管病原性Escherichia coli株の多遺伝子座可変数タンデム反復分析,フィロタイプおよび病原性遺伝子に基づく宿主範囲関連クラスタリング【JST・京大機械翻訳】

Host Range-Associated Clustering Based on Multilocus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis, Phylotypes, and Virulence Genes of Atypical EnteropathogenicEscherichia coliStrains

著者 (10件)： Parvej Md Shafiullah ,  Nakamura Hiromi ,  Alam Md Ashraful ,  Wang Lili ,  Zhang Shaobo ,  Emura Kazuo ,  Kage-Nakadai Eriko ,  Wada Takayuki ,  Hara-Kudo Yukiko ,  Nishikawa Yoshikazu
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 85  号： 6  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 649の家禽糞便試料から得られたABSTRACTA典型的腸病原性大腸菌(aEPEC)株(36の日本と50のバングラデシュ)を,分子疫学的方法によって分析した。Clermontの系統発生タイピングは,A群がB1(31%,27/86)より一般的(58%,50/86)であることを示した。ヒト下痢患者の間で優勢であるインチミン型β1は,両系統群B1(81%,22/27)およびA(70%,35/50)において優勢であった。しかし,B1-β1株の約95%は病原性群Iに属し,それらの77%は日本人株であり,一方A-β1株の17%(6/35)は株であった。マルチ遺伝子座可変数タンデム反復分析(MLVA)は,73%で多様性(D)のSimpson指数で,菌株を52の異なるプロファイルに分配した。データを異なる源からの142の以前の菌株のそれらと組み合わせたとき,最小スパニング木は,ブタ株,家禽株(B1-β1を除く),健康なヒト,ウシおよびヒト患者株からの菌株,およびB1-β1家禽株に対して5つの領域を形成した。ナリジクス酸に対する抗菌剤耐性は,分離株の中で最も一般的(74%)であった。それらの68%は≧3抗菌剤に対する耐性を示し,それらのほとんど(91%)はバングラデシュ由来であった。菌株を階層的クラスタリングによって2つの群に分けた。相関マトリックス分析は,病原性遺伝子が抗菌剤耐性と負に相関していることを明らかにした。本研究は,家禽,特に日本の家禽が,aEPECの別の貯水池(系統群B1,毒性群I,およびintimin型β1)であるかもしれないことを示唆した。しかし,家禽株はウシ株に近い患者株から離れているようである。バングラデシュaEPECは,ヒトに対して毒性が低いが,抗生物質に対してより耐性がある。IMPORTANCEA典型的腸病原性大腸菌(aEPEC)は,上皮の付着と効率化のためにintimin遺伝子(eae)を持つので,大腸菌の下痢性型である。aEPECは先進国でも遍在しているので,著者らは以前,ヒト病原体としてaEPECを識別するための分子疫学的方法を使用した。本研究では,ヒト下痢性aEPECの別の源として家禽を評価した。Poultryは,日本における患者株の間で見つかったaEPEC(系統B1,毒性群I,およびintimin型β1)の源であった。しかし,最小スパニング木(MST)は,日本の家禽からの菌株がウシと患者株間の距離と比較して日本の患者株から遠いことを示唆した。バングラデシュトリ株は下痢性が低いようであるが,薬剤耐性遺伝子の供給源として有害であった。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 効率化 ,  下痢 ,  抗細菌薬 ,  抗生物質 ,  上皮 ,  ヒト ,  系統発生 ,  *クラスタ化 ,  家禽 ,  *病原性 ,  病原体 ,  病原性大腸菌 ,  窒素複素環化合物 ,  ケト酸
準シソーラス用語： *縦列反復配列 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

物質索引 (1件)： ナリジクス酸

タイトルに関連する用語 (12件)： 定型 ,  腸管 ,  病原性 ,  Escherichia ,  株 ,  遺伝子座 ,  可変 ,  タンデム反復 ,  分析 ,  病原性遺伝子 ,  宿主範囲 ,  クラスタリング