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J-GLOBAL ID：202002286682703862   整理番号：20A0010137

日本ウナギ,Anguilla japonicaから得た良いおよび悪い品質の卵における母性転写物 大規模定量分析による同定【JST・京大機械翻訳】

Maternal transcripts in good and poor quality eggs from Japanese eel, Anguilla japonica-their identification by large-scale quantitative analysis

著者 (8件)： Izumi Hikari (Division of Marine Life Science, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Gen Koichiro (Seikai National Fisheries Research Institute, Fisheries Research Agency, Nagasaki, Japan) ,  Lokman P. Mark (Department of Zoology, University of Otago, Dunedin, New Zealand) ,  Hagihara Seishi (Division of Marine Life Science, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Horiuchi Moemi (Division of Marine Life Science, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Tanaka Toshiomi (Hamanako Branch, Shizuoka Prefectural Research Institute of Fishery, Shizuoka, Japan) ,  Ijiri Shigeho (Division of Marine Life Science, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Adachi Shinji (Division of Marine Life Science, Hokkaido University, Hokkaido, Japan)
資料名： Molecular Reproduction and Development  (Molecular Reproduction and Development)
巻： 86  号： 12  ページ： 1846-1864  発行年： 2019年 
JST資料番号： T0932A  ISSN： 1040-452X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 脊椎動物における発達の母性制御の理解は不完全である。本研究において,RNA-Seq及び定量的ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)を用いて,人工的に成熟したニホンウナギからの良好及び低品質の卵における母性転写産物のレベルを調べ,発生に関連する候補母性転写産物を同定した。ウナギドラフトゲノムへの読み取りのde novo集合またはマッピングは,それぞれ619,029のコンティグと85,906の転写産物をもたらした。これらの集合体に対する正規化された読み取り数を,100万個のマッピングされた読み取り当たりの転写物のキロベース当たりの読み取り(RPKM)またはフラグメント(FPKM)を用いて計算した。in silicoスクリーニングにより,低RPKMまたはFPKMを有する1,594のコンティグおよび150の転写物を,良好な品質の卵,245のコンティグ,および85の転写物において,それぞれBLASTによって注釈できることを同定した。選択されたコンティグまたは転写物から,6つの遺伝子(dnajb4,gnpat,CARD14,Pdp1,fcgbp,ttn)は,qPCRにより良質の卵よりも低いメッセンジャーRNAレベルを有意に低かった。多重回帰分析は,5つの遺伝子(gnpat,B4garnt1,acsl6,rtkn,TRIM24)が孵化性と有意に相関することを示した。まとめると,10の遺伝子は,日本ウナギにおける発達を調節する候補の母系転写物として同定された。著者らの結果は,脊椎動物における発生の母性制御のための分子基盤の理解に貢献する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多重回帰分析 ,  RNA【核酸】 ,  *品質 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  孵化 ,  脊椎動物 ,  PCR法 ,  凝集体 ,  正規化 ,  *定量分析 ,  mRNA ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： コンティグ ,  転写産物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 開発 ,  ウナギ ,  母性転写物 ,  QPCR

分類 (3件)： 発生と分化  (EJ16020W) ,  繁殖管理  (FD01030C) ,  生殖器官  (EJ15020P)

タイトルに関連する用語 (9件)： 日本 ,  ウナギ ,  Anguilla ,  卵 ,  母性 ,  転写 ,  大規模 ,  定量分析 ,  同定